该存储库包含我们题为“用于从整个幻灯片图像中提取格里森组织并分级前列腺癌的扩张式残留分层分割框架”的论文的实现。拟议框架的框图所提出的框架是使用TensorFlow 2.3.1和Keras API与Python 3.7.8开发的。此外,一些预处理步骤和结果汇编也通过MATLAB R2020a执行。下面显示了安装和运行代码的详细步骤:
安装
要运行代码库,需要以下库。虽然该框架是使用Anaconda开发的,但它应该与其他平台兼容。
- TensorFlow 2.3.1
- Keras 2.3.1
- OpenCV 4.4.0
- tqdm
- Matplotlib
另外,我们还提供了一个yml文件,其中包含所有这些软件包。
数据集
请下载所需的数据集,并按照以下提到的层次结构来训练和测试建议的框架:
├── trainingDataset
│ ├── train_images
│ │ └── tr_image_1.png
│ │ └── tr_image_2.png