秋海棠是由 Matlab 开发的框架,帮助解决星形胶质细胞 2 光子成像数据的科学图像分析核心挑战。其主要功能包括:

  1. 简单且维护成本低的 元数据存储策略
  2. 将手动分析步骤与自定义的 Matlab 工具集成;
  3. 处理与镜筒类型/图像来源无关的图像数据;
  4. 加入来自多个测量设备和来源的时间序列数据;
  5. 使用动态钙传感器对可见成像细胞和组织事件进行 自动或半自动分析

该系统专注于星形细胞钙信号传导,但同样适用于使用 2 光子激光显微镜 记录的荧光指示剂。系统为非程序员提供了图形化的工作流程,并为程序员提供了 API。我们发现 GUI 工具Matlab 处理 API 的结合效果良好,支持更多编程经验的研究人员可以在该框架下高效工作。非程序员可以快速使用该框架进行数据概述和 自动分析,并在收集数据时快速查看结果。

已知问题:使用 RoI 管理器(“roiman”)时,如果在窗口中单击以提升时间序列视图,可能会发生错误,导致 roiman 无法获取键盘事件。