双光子成像
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Matlab图片叠加代码-Begonia星形细胞Ca2+信号的双光子成像分析管线
秋海棠是由 Matlab 开发的框架,帮助解决星形胶质细胞 2 光子成像数据的科学图像分析核心挑战。其主要功能包括:
简单且维护成本低的 元数据存储策略;
将手动分析步骤与自定义的 Matlab 工具集成;
处理与镜筒类型/图像来源无关的图像数据;
加入来自多个测量设备和来源的时间序列数据;
使用动态钙传感器对可见成像细胞和组织事件进行 自动或半自动分析。
该系统专注于星形细胞钙信号传导,但同样适用于使用 2 光子激光显微镜 记录的荧光指示剂。系统为非程序员提供了图形化的工作流程,并为程序员提供了 API。我们发现 GUI 工具 和 Matlab 处理 API 的结合效果良好,支持更多编程经验的研究人员可以在该框架下高效工作。非程序员可以快速使用该框架进行数据概述和 自动分析,并在收集数据时快速查看结果。
已知问题:使用 RoI 管理器(“roiman”)时,如果在窗口中单击以提升时间序列视图,可能会发生错误,导致 roiman 无法获取键盘事件。
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2024-11-06
光谱分割算法Matlab代码开源CA成像处理工具,从双光子图像序列中提取神经痕迹
去自由基算法Matlab代码SpecSeg:慢性钙成像数据集中基于跨谱功率的神经元和神经突分割这个Github包含“ SpecSeg”,这是一个开放源码的钙成像处理工具箱,用于检测钙成像数据集中的感兴趣区域(ROI)。ROI分割基于频率范围内的互谱功率,并已针对各种神经元隔室(细胞体,树突,轴突)和成像技术(慢性玻璃窗,GRIN透镜,1P,2P)进行了测试和优化。SpecSeg工具箱包含用户友好的图形界面,可检测、调整ROI并可视化其活动轨迹。该管道包括从SpectralSegmentation下的代码,以将运动校正应用于SBX文件。为了执行运动校正,请从SpectralSegmentation下载代码并将其添加到Matlab路径中。可以使用代码在荧光迹线上进行峰值估计。MLspike需要工具箱。将MLspike和brick文件夹添加到Matlab路径。这是荷兰神经科学研究所(NIN)的Leveltlab使用的管道。可以使用脚本轻松手动执行每个步骤中的管道,或通过脚本自动运行管道以处理请求的多个文件,直到RoiManagerGUI需要手动输入。为何选择光谱分割工具箱
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2024-07-31
matlab光子晶体中光子模式密度的开发
matlab开发-光子晶体中光子模式密度。1d phc中允许的光子模式总密度;由两个均匀层组成的单元。
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2024-09-28
聚束SAR成像技术及其成像指标分析
聚束SAR(Synthetic Aperture Radar)成像技术在雷达成像领域具有重要应用,其成像指标包括分辨率、覆盖范围和数据处理速度等关键参数。聚束SAR成像技术通过合成孔径雷达技术实现高分辨率的地面目标探测,广泛应用于地质勘探、环境监测和灾害评估等领域。
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2024-08-17
MATLAB超材料光子晶体传输光谱模型
利用传递矩阵法建立了一维光子晶体光学特性的MATLAB模型。该模型基于含金属纳米粒子的超材料光子晶体的透射光谱进行理论描述,并在不同晶体参数下进行了详细分析。初始材料为GaAs(eps1 = 11.9)和GaN(eps2 = 5.8),总厚度为2500 nm。
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2024-09-25
解析分子成像 AFM 文件
ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区,并将数据加载到 MATLAB 矩阵中,方便后续分析和处理。
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2024-05-25
SAR成像MATLAB代码简介
关于我:你好,我是TY,毕业于梨花女子大学,主修机械与生物医学工程,辅修计算机科学工程。我对深度学习、机器学习、计算机视觉和自然语言处理等领域特别感兴趣。在技术博客和GitHub上分享我的研究成果和项目经验。我曾获得多个奖项,包括2020年ICT Kok AI Contest的二等奖和2020年KISTI研究数据• AI分析应用大赛的二等奖。持有ADsP(高级数据分析半专业)证书。
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2024-07-31
MATLAB光子扩散发生器开发指南
MATLAB开发-光子扩散发生器。该程序对人体组织中光子扩散的点源解进行了参数化。通过这一程序,用户可以设置不同参数以观察光子在人体组织中的扩散行为。该模型特别适用于研究生物组织中光传播的特性,方便用户在光子扩散仿真领域进行进一步研究。
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2024-11-05
超声成像工具箱优化
Matlab超声成像波束合成工具箱Beamformation Toolbox。本目录包含用于超声成像的工具箱。当前目录包括:文档目录(PDF、HTML格式)、bft_*.m文件集、示例目录、C文件目录和头文件目录。
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2024-07-27
MATLAB生成谐波代码光子力显微镜的自动校准
MATLAB GUI描述了用于光子力显微镜的谐波生成代码。光子力显微镜是一种功能强大的工具,能够在皮克顿级上测量力并检测纳米级位移。校准方法的精度对仪器的精确性至关重要。我们提供了一个交互式校准软件,能够同时处理探头轨迹的统计观测值,包括功率谱密度、均方位移和速度自相关函数,以提高校准的精度。该软件在高采样率下处理实验观察到的流体动力学相互作用,并考虑光学捕获中不对称物体方向上的热涨落。该校准方法适用于非球形探针,已经通过合成和实验数据验证。
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2024-09-27