Matlab的LPI_KTASLP方法基于半监督链接预测,专注于lncRNA与蛋白质的相互作用和核靶标的比对。输入数据以矩阵形式表示lncRNA和蛋白质的相似性,其中高斯相似度矩阵由kernel_gip.m构建。核心方法代码存储在LapkronrlsMF.m文件中。所有代码和结果以.rar格式打包,方便下载和上载。要运行程序,请确保.mat和代码文件在同一目录下。使用MATLAB环境,建议4核CPU和20 GB内存,64位Windows操作系统。数据基准数据集详见[1],包括4158个lncRNA-蛋白质相互作用,990个lncRNA和27个蛋白质。结果展示包括AUC.fig、AUPR_loo.fig、AUC_loo.fig、AUPR.fig和results_TKA_LapMFsum.mat。案例研究结果存放在local_cases文件夹中。参考资料:[1]