lncRNA
当前话题为您枚举了最新的 lncRNA。在这里,您可以轻松访问广泛的教程、示例代码和实用工具,帮助您有效地学习和应用这些核心编程技术。查看页面下方的资源列表,快速下载您需要的资料。我们的资源覆盖从基础到高级的各种主题,无论您是初学者还是有经验的开发者,都能找到有价值的信息。
TPGLDA:使用三方图预测lncRNA-疾病关联的工具
TPGLDA 是一款基于MATLAB的工具,可利用三方图(lncRNA-疾病-基因)预测lncRNA与疾病之间的关联。
要求:- 内存:4GB- MATLAB:R2015a 或更高版本
数据准备:将已知的 lncRNA-疾病关联和基因-疾病关联加载到三方图中:- known_lncRNA_disease_interaction.txt- known_gene_disease_interaction.txt
使用 TPGLDA:- 加载实验验证的 lncRNA-疾病关联和基因-疾病关联数据。- 运行 TPGLDA 推断潜在的 lncRNA-疾病关联。
Matlab
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2024-04-30
MATLAB代码-LPI_KTASLP基于半监督链接预测的lncRNA-蛋白质相互作用与核靶标比对方法
Matlab的LPI_KTASLP方法基于半监督链接预测,专注于lncRNA与蛋白质的相互作用和核靶标的比对。输入数据以矩阵形式表示lncRNA和蛋白质的相似性,其中高斯相似度矩阵由kernel_gip.m构建。核心方法代码存储在LapkronrlsMF.m文件中。所有代码和结果以.rar格式打包,方便下载和上载。要运行程序,请确保.mat和代码文件在同一目录下。使用MATLAB环境,建议4核CPU和20 GB内存,64位Windows操作系统。数据基准数据集详见[1],包括4158个lncRNA-蛋白质相互作用,990个lncRNA和27个蛋白质。结果展示包括AUC.fig、AUPR_loo.fig、AUC_loo.fig、AUPR.fig和results_TKA_LapMFsum.mat。案例研究结果存放在local_cases文件夹中。参考资料:[1]
Matlab
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2024-09-21