该项目通过Python自动检测显微照片中不同尺寸圆形物体,并提取其像素亮度值,以及通过Matlab中的ODE模型描述不同纳米管单体行为的时间动态。图像处理部分利用数字图像处理(DIP)从每幅图像数十个液滴(在斐济手工)扩展到每幅图像数百个液滴。脚本可处理Nikon NIS-Elements的“.nd2”文件,并可调整以处理其他格式。该项目包含动态自组装项目液滴检测和数据提取的所有脚本,推荐使用建议的目录组织,但不强制要求。依赖项详见“.dependencies”文件。使用ND2Reader自nd2reader的工作流程为预处理 > nd2_brightness_adjust_fiji.py。此文件夹包含使用ImageJ或Fiji脚本编辑器的脚本。
液滴检测脚本转换及动态自组装项目的MATLAB代码
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