分子模拟

该存储库包含了模拟光镊中常见的分子马达动力学的Matlab代码。模拟涵盖了简单的泊松步进和更复杂的酶动力学，例如延伸RNA聚合酶II（RNAP II）。这些模拟受到了Dangkulwanich等人最近实验的启发，显示了单个分子马达在基底上位置的阶梯状变化。模拟方法解决了噪声问题，例如谐波捕获的粒子噪声和仪器本身的噪声，并能生成泊松分布的阶跃，以及在易位和暂停状态之间切换的酶步跃。所有位置单位为nm，力单位为pN，速率单位为Hz。在Matlab中，使用以下三个命令即可生成基于默认参数的噪声步长数据：sd = SimData（）; sd = sd.simulat

ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区，并将数据加载到 MATLAB 矩阵中，方便后续分析和处理。

(1)合并各分E-R图使用更符合用户习惯的别名，消除命名冲突，确保数据库系统中同一关系和属性具有唯一的名字。在设计数据库整体结构时，这一步骤显得尤为重要。 (2)对于某些局部应用，应特别注意使用符合用户习惯的属性名，以增加使用者的便利性。

设计用户子模式 在数据库设计中，用户子模式的创建非常重要。通过使用更符合用户习惯的别名，可以为不同级别的用户定义不同的View，以确保系统的安全性。此外，简化用户对系统的操作也是一个关键因素。一般的DBMS都提供了视图的概念，可以利用这一功能为局部用户设计更合适的用户外模式。需要考虑的因素包括：- 用户需求- 权限管理- 操作简化

matlab开发-光子晶体中光子模式密度。1d phc中允许的光子模式总密度；由两个均匀层组成的单元。

本存储库包含了研究文章“使用动态半参数因子模型进行的收益曲线建模与预测”中使用的MATLAB代码，作者为HärdleWolfgang Karl和Majer Piotr（2012），发表于CRC 649讨论文件，2012-48期。该研究利用动态半参数因子模型（DSFM）分析了欧元引入后的欧洲主权债务危机期间希腊、意大利、葡萄牙和西班牙四个南欧国家的月利率。与动态Nelson-Siegel模型相比，研究发现DSFM技术能更好地捕捉每个债券市场收益率曲线的结构，尤其是斜率方面的变化。面板数据分析显示，需要三个非参数因子来解释95%的收益率变动，估计的因子负荷表现出较高的持久性。

基于信息可视化软件，分析了2000-2019年分子筛领域27519篇英文文献，绘制了知识图谱，揭示研究热点和新趋势。

分享了MATLAB绘制分子结构的源程序代码，详细介绍了如何利用MATLAB进行分子结构的图形绘制。具体程序代码请参见附件。如需获取资料或有任何疑问，请联系我QQ 1530497909。

modelled_systems modelled_systems是一个汇集了参考和规范数据的仓库，用于分子计算分析和模拟，涵盖： 实验结构 建模对接 MD模拟结构 分析和数据挖掘 该仓库以“系统”集合的形式组织在systems文件夹中。每个文件夹代表一个独特的系统，其名称 (system_id) 可作为其他情况下的参考标识符。 系统篇 “系统”的定义 “系统”是指一组独特的目标化学物质，通常对应于单个RCSB PDB ID（例如BTK-cIAP-TL7例子中的6w7o）。系统包含构成主要研究对象的成分，例如蛋白质和小分子，而不包括结晶水等次要成分。

原子力显微镜测量链霉亲和素-生物素复合物的断裂力。采用常规方法和模糊逻辑算法处理力曲线，以确定断裂力的分布。基于模糊逻辑的分析消除了热噪声伪影，从而得出更高的断裂力。研究表明，方法的选择会影响对配体-受体相互作用的理解。