分子模拟

使用Matlab生成谐波代码-ebs_simulation镊子分子马达模拟

该存储库包含了模拟光镊中常见的分子马达动力学的Matlab代码。模拟涵盖了简单的泊松步进和更复杂的酶动力学，例如延伸RNA聚合酶II（RNAP II）。这些模拟受到了Dangkulwanich等人最近实验的启发，显示了单个分子马达在基底上位置的阶梯状变化。模拟方法解决了噪声问题，例如谐波捕获的粒子噪声和仪器本身的噪声，并能生成泊松分布的阶跃，以及在易位和暂停状态之间切换的酶步跃。所有位置单位为nm，力单位为pN，速率单位为Hz。在Matlab中，使用以下三个命令即可生成基于默认参数的噪声步长数据：sd = SimData（）; sd = sd.simulat

Matlab 1 2024-07-26

解析分子成像 AFM 文件

ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区，并将数据加载到 MATLAB 矩阵中，方便后续分析和处理。

Matlab 3 2024-05-25

数据库课件设计用户子模式续

(1)合并各分E-R图使用更符合用户习惯的别名，消除命名冲突，确保数据库系统中同一关系和属性具有唯一的名字。在设计数据库整体结构时，这一步骤显得尤为重要。 (2)对于某些局部应用，应特别注意使用符合用户习惯的属性名，以增加使用者的便利性。

SQLServer 0 2024-08-22

分子筛研究动态可视化分析

基于信息可视化软件，分析了2000-2019年分子筛领域27519篇英文文献，绘制了知识图谱，揭示研究热点和新趋势。

统计分析 5 2024-04-30

因子模型矩阵的多元统计分析与因子分析

在多元统计分析中，因子模型矩阵扮演着重要角色。因子分析通过对因子模型矩阵的分析，揭示出变量之间的潜在关系。

统计分析 0 2024-08-27

MATLAB绘制分子结构源程序优化分享

分享了MATLAB绘制分子结构的源程序代码，详细介绍了如何利用MATLAB进行分子结构的图形绘制。具体程序代码请参见附件。如需获取资料或有任何疑问，请联系我QQ 1530497909。

Matlab 0 2024-08-17

PXRD模拟

该代码基于Matlab实现PXRD模拟，适用于毕业设计和课程设计作业。已严格测试，可直接使用。如遇问题，欢迎与博主联系。

Matlab 6 2024-05-13

精心组织的分子系统集合：modelled_systems

modelled_systems modelled_systems是一个汇集了参考和规范数据的仓库，用于分子计算分析和模拟，涵盖： 实验结构 建模对接 MD模拟结构 分析和数据挖掘 该仓库以“系统”集合的形式组织在systems文件夹中。每个文件夹代表一个独特的系统，其名称 (system_id) 可作为其他情况下的参考标识符。 系统篇 “系统”的定义 “系统”是指一组独特的目标化学物质，通常对应于单个RCSB PDB ID（例如BTK-cIAP-TL7例子中的6w7o）。系统包含构成主要研究对象的成分，例如蛋白质和小分子，而不包括结晶水等次要成分。

数据挖掘 3 2024-05-15

模糊逻辑算法用于单分子力谱的分析

原子力显微镜测量链霉亲和素-生物素复合物的断裂力。采用常规方法和模糊逻辑算法处理力曲线，以确定断裂力的分布。基于模糊逻辑的分析消除了热噪声伪影，从而得出更高的断裂力。研究表明，方法的选择会影响对配体-受体相互作用的理解。

统计分析 3 2024-05-20

MDToolboxMATLABOctave分子动力学轨迹统计分析工具

MDToolbox是专为MATLAB和Octave设计的工具箱，用于分析分子动力学轨迹的统计特性。它提供了丰富的功能，帮助研究人员深入理解分子系统的动态行为。MDToolbox支持多种数据分析技术，为科学家们在研究复杂生物分子相互作用和结构动态性方面提供了强大的工具。

Matlab 2 2024-08-01