modelled_systems

modelled_systems是一个汇集了参考和规范数据的仓库,用于分子计算分析和模拟,涵盖:

  • 实验结构
  • 建模对接
  • MD模拟结构
  • 分析和数据挖掘

该仓库以“系统”集合的形式组织在systems文件夹中。每个文件夹代表一个独特的系统,其名称 (system_id) 可作为其他情况下的参考标识符。

系统篇

“系统”的定义

“系统”是指一组独特的目标化学物质,通常对应于单个RCSB PDB ID(例如BTK-cIAP-TL7例子中的6w7o)。系统包含构成主要研究对象的成分,例如蛋白质和小分子,而不包括结晶水等次要成分。