该存储库包含了模拟光镊中常见的分子马达动力学的Matlab代码。模拟涵盖了简单的泊松步进和更复杂的酶动力学,例如延伸RNA聚合酶II(RNAP II)。这些模拟受到了Dangkulwanich等人最近实验的启发,显示了单个分子马达在基底上位置的阶梯状变化。模拟方法解决了噪声问题,例如谐波捕获的粒子噪声和仪器本身的噪声,并能生成泊松分布的阶跃,以及在易位和暂停状态之间切换的酶步跃。所有位置单位为nm,力单位为pN,速率单位为Hz。在Matlab中,使用以下三个命令即可生成基于默认参数的噪声步长数据:sd = SimData(); sd = sd.simulat