马氏距离matlab原始代码引文GTASSIST:大规模SNP基因分型的基因标记选择的客观评估措施Kaminuma E,Masuya H,Miura I,Motegi H,Takahasi KR,Nakazawa M,Matsui M,Gondo Y,Noda T,Shiroishi T,Wakana S,Toyoda T J Bioinform Comput Biol。2008 6:905-17。执照瑞肯:保留所有权利。请检查。联系信息如果您对GTASSIST软件有任何疑问,请向国家遗传学研究所和RIKEN BRC咨询。GTASSIST指令&< GTAssist>> GTAssist是在SNP基因分型过程中协助标记选择和等位基因识别的工具。该程序支持TaqMan检测的二维荧光散射图的两种有用的评估方法[1],这是SNP基因分型中的一种流行技术。可以在后续的基因分型过程中使用这两种建议的措施。提出的第一个度量是标记排名度量(MRM),用于选择分布良好的SNP标记而不依赖于聚类结果。提议的第二项措施是个体基因型成员度量(IGMM),该度量利用
GTASSIST SNP基因分型中遗传标记选择的客观评价措施
相关推荐
分型几何中的基本三分模型
分型集合的基本模型,为初学者提供了分型模型的直观感受。
Matlab
1
2024-08-01
使用Sequenom Mass Array生成的基因分型信息创建pedfile-Matlab开发
此脚本已免费上传到Matlab Central,作者未提供任何保证。脚本整合多次运行Mass Array Sequenom生成的基因分型信息。每次Sequenom运行均使用MASSARRAY TYPER 4.0.20软件处理。该软件支持生成xls格式报告。此脚本特别用于组合来自GenotypeArea.xls报告的数据。输入文件包括:samplefile.txt(包含样本、性别、年龄、pheno四列,必须有标题)和mapfile.txt(包含地图信息)。
Matlab
0
2024-09-26
Vandesompele参考基因选择方法的Matlab实现
这个脚本实现了Jo Vandesompele等人在文章《通过几何平均多个内部对照基因对实时定量RT-PCR数据进行准确归一化》中提出的参考基因选择方法,用Matlab编写。
Matlab
0
2024-09-27
dbSNP数据库中的SNP数据
dbSNP数据是指一条具体的多态性位点数据,如图1所示,其中间行表示多态性位点,R代表嘌呤(即G或A)。图1中使用了IUPAC的代号。
SQLServer
0
2024-08-12
基于遗传算法的数据挖掘规则生成系统评价
利用遗传算法优化数据挖掘算法,提高信息挖掘效率。
数据挖掘
3
2024-05-20
畜禽基因组选择方法的最新研究进展2020
随着科技的进步,畜禽基因组选择方法在2020年已经取得了显著进展。
算法与数据结构
2
2024-07-13
Slater 社会选择理论下的在线服务评价方法
提出一种基于 Slater 社会选择理论的在线服务评价方法。该方法通过填充稀疏评分矩阵,构建服务有向图,判断节点指向关系和排序,得出服务评价结果。实验表明,该方法抗操控性强,符合孔多塞准则,能体现多数用户偏好。
数据挖掘
8
2024-05-01
MATLAB检测医学图像中的矩形标记
在医学图像中,检测矩形标记是一项重要任务。本项目使用形态学开口和霍夫变换来自动识别医生标记的感兴趣区域。例如,在甲状腺超声图像中,周围的白色细框表示重要区域。尽管这些框的灰度通常是固定的,但背景干扰可能导致误判。因此,本项目提出了一种结合两种技术的方法,以有效识别和提取这些区域,减少手动处理的时间和误差。
Matlab
0
2024-11-03
遗传基因算法MATLAB代码移动边缘计算论文实现
LODCO算法是在论文“使用能量收集设备进行移动边缘计算的动态计算LODCO Algorithm”中提出的,相关MATLAB代码为LODCO.m。基于LODCO的贪婪算法LODCO-Based Greedy Algorithm和epsilon-Greedy算法LODCO-Based epsilon-Greedy Algorithm分别在论文“具有能量收集设备的多服务器移动边缘计算系统的执行成本和公平性优化”中描述,并附有相应的MATLAB代码LODCO_based_Greedy.m和LODCO_based_e_Greedy.m。另外,基于贪心策略的基于LODCO的遗传算法LODCO-Based Genetic Algorithm with Greedy Policy也在相同论文中提及。
Matlab
0
2024-10-02