LAND 软件包对单分子定位显微镜 (SMLM) 数据进行定量分析,尤其适用于处理大样本量和高发射体密度的数据。

功能

  • 2D 和 3D SMLM 数据分析算法:
    • 基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN)
    • 基于 Voronoi 的聚类分析
    • 里普利函数
    • 径向分布函数 (RDF)
    • 最近邻分析 (NN)
    • 距离分析
  • 用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText)
  • 数据可视化
  • 具有批处理功能的用户界面

软件获取与安装

  1. 下载软件包并解压缩 LAND-master.zip 文件。
  2. 将生成的 LAND-master 目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。
  3. 在 MATLAB 命令窗口中,导航到 LAND-master 目录并运行 LAND 启动软件。

文档和示例

有关如何使用该软件的详细说明(包括示例),请参阅软件包中的文档。

系统要求

  • MATLAB R2014b 或更新版本
  • 统计和机器学习工具箱
  • 图像处理工具箱(可选,但强烈建议用于更快的计算)
  • 建议至少 8 GB RAM