LAND 软件包对单分子定位显微镜 (SMLM) 数据进行定量分析,尤其适用于处理大样本量和高发射体密度的数据。
功能
- 2D 和 3D SMLM 数据分析算法:
- 基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN)
- 基于 Voronoi 的聚类分析
- 里普利函数
- 径向分布函数 (RDF)
- 最近邻分析 (NN)
- 距离分析
- 用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText)
- 数据可视化
- 具有批处理功能的用户界面
软件获取与安装
- 下载软件包并解压缩
LAND-master.zip
文件。 - 将生成的
LAND-master
目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。 - 在 MATLAB 命令窗口中,导航到
LAND-master
目录并运行LAND
启动软件。
文档和示例
有关如何使用该软件的详细说明(包括示例),请参阅软件包中的文档。
系统要求
- MATLAB R2014b 或更新版本
- 统计和机器学习工具箱
- 图像处理工具箱(可选,但强烈建议用于更快的计算)
- 建议至少 8 GB RAM