查看图像堆栈GUI探索延时显微镜数据集

MIST是一个拼接2D图像数据集的工具，专为显微镜图像设计。它支持将时间序列数据处理为独立的数据集，并且能够处理具有10%重叠的图块。该工具的第一个版本为ImageJ / Fiji插件，未来将推出独立工具。该存储库包含两个分支：一个为插件的源代码，另一个为MATLAB原型的源代码。更新至CUDA 9.0将提升性能，特别是在现代GPU上。关于安装说明和用户指南，请参见快速导航中的相关信息。

MATLAB 代码用于处理点击扩展显微镜数据。包括刚性配准、膨胀因子计算、B样条非刚性配准、畸变场计算和均方根误差计算。

LSMAQ 是一款基于 MATLAB 编写，轻便灵活的激光扫描显微镜采集软件，支持 National Instruments 硬件进行振镜扫描。 主要功能： 与 MHz 速率激光器进行脉冲同步（例如三光子显微镜） 平铺体积采集 任意平面 3D 扫描 用于波前整形的相位步进 适用对象： LSMAQ 主要面向显微镜开发人员，提高灵活性和定制化程度。扫描引擎和用户界面分离，代码库轻量简洁，便于脚本编写和快速修改。 与其他软件对比： 对于双光子显微镜的最终用户，ScanImage 等现有软件包可能更为适用，因为它们功能完善，更新及时。LSMAQ 则更侧重于灵活性，公开了所有扫描参数，用户需要了解硬件限制并进行相应设置。 支持： LSMAQ 团队不提供最终用户支持。 系统要求： MATLAB (已测试版本 2019b)

提供MATLAB算法和工具源码，适用于毕业设计和课程设计作业。所有源码均经过严格测试，保证可直接运行，安心下载使用。如有任何问题，欢迎随时联系，我们将第一时间解答。

MATLAB GUI描述了用于光子力显微镜的谐波生成代码。光子力显微镜是一种功能强大的工具，能够在皮克顿级上测量力并检测纳米级位移。校准方法的精度对仪器的精确性至关重要。我们提供了一个交互式校准软件，能够同时处理探头轨迹的统计观测值，包括功率谱密度、均方位移和速度自相关函数，以提高校准的精度。该软件在高采样率下处理实验观察到的流体动力学相互作用，并考虑光学捕获中不对称物体方向上的热涨落。该校准方法适用于非球形探针，已经通过合成和实验数据验证。

高光谱CARS显微镜和光谱工具箱使研究人员能够方便地分析他们的数据。该工具箱专注于图像融合、去噪和光谱学的研究与开发。

LAND 软件包对单分子定位显微镜 (SMLM) 数据进行定量分析，尤其适用于处理大样本量和高发射体密度的数据。 功能 2D 和 3D SMLM 数据分析算法: 基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN) 基于 Voronoi 的聚类分析 里普利函数 径向分布函数 (RDF) 最近邻分析 (NN) 距离分析 用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText) 数据可视化 具有批处理功能的用户界面 软件获取与安装 下载软件包并解压缩 LAND-master.zip 文件。 将生成的 LAND-master 目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。 在 MATLAB 命令窗口中，导航到 LAND-master 目录并运行 LAND 启动软件。 文档和示例 有关如何使用该软件的详细说明（包括示例），请参阅软件包中的文档。 系统要求 MATLAB R2014b 或更新版本 统计和机器学习工具箱 图像处理工具箱（可选，但强烈建议用于更快的计算） 建议至少 8 GB RAM

这是一段用MATLAB编写的代码，用于处理原子力显微镜（AFM）在带有球形压头的细胞上获得的原始力光谱数据。代码包括预处理数据和杨氏模量的拟合，使用赫兹模型来增加压痕深度。所有代码在MATLAB R2016a版本上进行了测试，原始数据来自JPK Nanowizard 3显微镜的力谱.txt文件，其中包含悬臂高度、悬臂垂直挠度、串联时间和分段时间。预处理数据使用MATLAB代码AFM1_contactpoint.m进行单独处理。

8.2可查看的参数对下面的变量而言，每步长时间模拟的结果都可以在地图中进行显示，同时模拟的结果也可以用于制图、表格和进行统计分析。子流域变量包括：降水速率（英寸/小时或毫米/小时）、积雪深度（英寸或毫米）、损耗（下渗+蒸发，单位：英寸/小时或毫米/小时）、汇流（流量单位）、地下水进入排水系统中的水量（流量单位）、地下水高程（英尺或米）、每种污染物的浓度（质量/升）连接变量包括：流量速率（流量单位）、平均水深（英尺或米）、流速（英/秒或米/秒）、弗劳德数（无量纲因子）、容量能力（从当前深度到蓄满深时的比率）、每种污染物的浓度（质量/升）节点变量包括：水深（在转向节点以上的高度，英尺或米）、液压水头（每单位面积在垂向上绝对高程，英尺或米）、储水容量（包括积水量，立方英尺或立方米）、侧向入流（汇流+所有其它的外部入流，流量单位）、总入流（侧向入流+上游的入流，流量单位）、表面洪水（当节点满负荷时超出的水量，流量单位）、治理之后每种污染物的浓度（质量/升）系统输入变量包括：空气温度（F或C）、蒸发速率（英寸/天或毫米/天）、总降水量（英寸/天或毫米/天）、总降雪深（英寸或毫米）、平均损失（英寸/天或毫米/天）、总径流（流量单位）、晴天总入流（流量单位）、地下水总入流（流量单位）、总RDII入流（流量单位）、总直接入流（流量单位）、总外部的洪水（流量单位）、从出水口的总出水量（流量单位）、节点总储水量（立方英尺或立方米）以上这些变量中，只有被选择并且模拟结果的时间序列被保存过的子流域、节点和连接的变量才能被显示。除非Report >> Options命令正在显示指定对象的报告，否则在工程中所有的类似对象的变量都可以被显示。 8.3图中可显示的参数有以下几种直接将某些输入的参数和模拟的结果直接在地图上显示的方法：在当前数据浏览状态栏下，地图中的子流域、节点和连接将根据地图图例颜色的分类进行相应的显示。如果在数据浏览栏选择了一个新的时间，地图中的颜色将进行相应的更新。当勾选了快速浏览地图标签程序，用鼠标在地图上在各对象之间移动，将在提示框中显示当前对象的ID名称和当前主题参数的参数值。在地图选项对话框的注解页面下，选择适当的按钮几乎可以对所有子流域、节点和连接的ID名称和参数值进行显示。满足地图查询设定特定条件的子流域、节点和连接可以被显示。利用数据浏览页面下的动画播