基因数据

基因数据集中的致病位点分析

数据集中包含两个致病位点，分别编号为11和21。该数据集由2000个样本组成，包括1000个健康人和1000个患者。每个样本包含1000个位点，其中最小等位基因频率（MAF）为0.2，主效应值为0.5，连锁不平衡（LD）值为1。

算法与数据结构 8 2024-07-16

SciDB 基因 + 现象数据分析范例

SciDB 笔记本展示使用 SciDB 处理基因型 + 表型数据集，包含简单的聚合和高级计算。该工作基于 SciDB 的横向扩展功能和复杂数学计算能力。

统计分析 11 2024-05-13

基因算法与函数优化

基因算法是模拟达尔文生物进化理论的计算模型，通过模拟自然进化过程来搜索最优解。它起始于一个代表问题解集的种群，每个个体都带有基因编码的特征。染色体作为主要的遗传载体，内部表现为某种基因组合，决定个体的外部表现特征，例如黑发。

算法与数据结构 10 2024-07-27

FMUT质因数单变量ERP工具箱（FMUT）

阶乘质量单变量ERP工具箱（FMUT）版本0.5.1，由埃里克·菲尔德编写，扩展了David Groppe的质量单变量ERP工具箱。 FMUT实现了基于置换和错误发现率的质量单变量统计，适用于ANOVA和事件相关电位（ERP）数据的析因设计。 FMUT的下载和安装说明可以在FMUT文档中找到。

Matlab 8 2024-08-30

使用Simulink进行功率因数测量的模块开发

介绍了如何通过Simulink开发功率因数测量模块，详细解释了功率因数的计算方法：功率因数=实际功率/视在功率。

Matlab 6 2024-09-30

基因示意图-dbSNP数据库

基因示意图展示了基因的表达过程。dbSNP数据库是一个广泛使用的数据库，用于存储和管理单核苷酸多态性（SNP）数据，帮助研究人员理解基因变异对表达的影响。

SQLServer 11 2024-07-30

利用宏基因组数据组装某物种基因组一组装指南

详细介绍了利用宏基因组数据组装某物种基因组的整个流程，包括数据预处理、三种不同组装工具的应用（Minia、SPAdes和Megahit），以及组装结果的评估和比较。首先进行宏基因组数据的预处理，包括参考基因组的比对、reads的提取和过滤。随后使用Minia、SPAdes和Megahit进行基因组组装，分别介绍了它们的特点和适用情况。最后通过Quast评估组装结果，比较了三种工具的效果。为利用宏基因组数据进行某物种基因组组装提供了详细指南。

数据挖掘 11 2024-07-16

磷循环基因分析过滤代码

磷循环基因数据库 (PCyCDB) PCyCDB 数据库包含 138 个基因家族和 10 个代谢过程，并添加了同源基因以降低假阳性率。 通过识别已知的模拟基因数据集和模拟细菌群落，优化了序列相似性搜索工具（例如 BLAST、USEARCH、DIAMOND）生成的比对结果的过滤标准（即同一性、匹配长度），以获得最佳准确性和进一步降低假阳性。

数据挖掘 9 2024-05-12

生物信息学中基因表达与基因对分析的C++实现

生物信息学领域中，基因表达和基因对分析对于肿瘤研究至关重要。详述了如何利用C++编程语言进行基因对的两两配对，并计算在肿瘤和正常样本中出现反转配对的基因。我们讨论了C++在生物信息学中的应用、基因表达的原理以及基因对分析的具体方法。C++因其高效性和性能优势，在处理大规模基因数据时具有明显优势。基因表达和反转配对分析可以帮助识别出肿瘤相关的关键基因对，为后续的病理研究和药物靶点筛选提供重要线索。

数据挖掘 7 2024-09-14

clusterProfiler R包实现基因和基因簇功能分析与可视化

clusterProfiler 该软件包实现了分析和可视化基因组坐标（由支持），基因和基因簇的功能概况的方法。有关详细信息，请访问。 :writing_hand: 作者余光创（南方医科大学基础医学院）使用 clusterProfiler 时，请引用以下文章：于庚，王L，韩Y和何Q。 clusterProfiler：一个R包，用于比较基因簇之间的生物学主题。OMICS：综合生物学杂志*。 2012，16（5）：284-287。

统计分析 6 2024-11-06