磷循环基因数据库 (PCyCDB)
PCyCDB 数据库包含 138 个基因家族和 10 个代谢过程,并添加了同源基因以降低假阳性率。
通过识别已知的模拟基因数据集和模拟细菌群落,优化了序列相似性搜索工具(例如 BLAST、USEARCH、DIAMOND)生成的比对结果的过滤标准(即同一性、匹配长度),以获得最佳准确性和进一步降低假阳性。
PCyCDB 数据库包含 138 个基因家族和 10 个代谢过程,并添加了同源基因以降低假阳性率。
通过识别已知的模拟基因数据集和模拟细菌群落,优化了序列相似性搜索工具(例如 BLAST、USEARCH、DIAMOND)生成的比对结果的过滤标准(即同一性、匹配长度),以获得最佳准确性和进一步降低假阳性。