基因数据集中的致病位点分析

SciDB 基因 + 现象数据分析范例

SciDB 笔记本展示使用 SciDB 处理基因型 + 表型数据集，包含简单的聚合和高级计算。该工作基于 SciDB 的横向扩展功能和复杂数学计算能力。

统计分析 5 2024-05-13

磷循环基因分析过滤代码

磷循环基因数据库 (PCyCDB) PCyCDB 数据库包含 138 个基因家族和 10 个代谢过程，并添加了同源基因以降低假阳性率。 通过识别已知的模拟基因数据集和模拟细菌群落，优化了序列相似性搜索工具（例如 BLAST、USEARCH、DIAMOND）生成的比对结果的过滤标准（即同一性、匹配长度），以获得最佳准确性和进一步降低假阳性。

数据挖掘 2 2024-05-12

生物信息学中基因表达与基因对分析的C++实现

生物信息学领域中，基因表达和基因对分析对于肿瘤研究至关重要。详述了如何利用C++编程语言进行基因对的两两配对，并计算在肿瘤和正常样本中出现反转配对的基因。我们讨论了C++在生物信息学中的应用、基因表达的原理以及基因对分析的具体方法。C++因其高效性和性能优势，在处理大规模基因数据时具有明显优势。基因表达和反转配对分析可以帮助识别出肿瘤相关的关键基因对，为后续的病理研究和药物靶点筛选提供重要线索。

数据挖掘 0 2024-09-14

探寻数据中的异常：孤立点分析

在数据库中，总会存在一些特立独行的对象，它们与其他数据的行为模式格格不入，这些便是孤立点。 如何识别这些“异类”呢？ 统计测试: 假设数据服从某种分布或概率模型，并利用距离度量，那些远离其他数据对象的点就被视为孤立点。 偏差检测: 通过分析对象在主要特征上的差异，而不是依赖统计或距离度量，来识别孤立点。 聚类分析的副产品: 在聚类分析中，那些包含对象数量少于设定阈值的簇，其中的对象通常被视为孤立点。

数据挖掘 5 2024-04-30

高效实现差异基因分析的R代码示例

此资源非常有用，希望能够对大家有帮助。好资源欢迎大家共享，共同提升数据分析的效率！

算法与数据结构 0 2024-10-26

基于主元分析的点云位姿估计与初步拼接Matlab实现

利用主元分析（PCA）对两组点云数据进行粗略配准，为后续ICP算法提供预处理。本方法探索了PCA主元向量的定向应用，附带提供了多角度下的bunny模型数据（ply文件格式）。

Matlab 1 2024-07-31

共现基因分析工具SimilaryViewer开源项目

SimilaryViewer是一款用于识别77种蓝藻生物子集中共同出现基因的工具。该软件提供MATLAB脚本及适用于Mac、Linux和Windows的独立应用程序。安装方法简单：下载相应zip文件，解压并按README文件操作。SimilaryViewer及其数据基于Apache许可版本2.0。科研使用请引用相关论文。图形导出功能依赖于Oliver Woodford和Yair Altman提供的“export_fig”工具箱版本1.99。

Matlab 0 2024-09-26

clusterProfiler R包实现基因和基因簇功能分析与可视化

clusterProfiler 该软件包实现了分析和可视化基因组坐标（由支持），基因和基因簇的功能概况的方法。有关详细信息，请访问。 :writing_hand: 作者余光创（南方医科大学基础医学院）使用 clusterProfiler 时，请引用以下文章：于庚，王L，韩Y和何Q。 clusterProfiler：一个R包，用于比较基因簇之间的生物学主题。OMICS：综合生物学杂志*。 2012，16（5）：284-287。

统计分析 0 2024-11-06

使用Simulink进行功率因数测量的模块开发

介绍了如何通过Simulink开发功率因数测量模块，详细解释了功率因数的计算方法：功率因数=实际功率/视在功率。

Matlab 0 2024-09-30