PIV图像分析

基于像素强度统计的PIV图像分析自动生成掩模

卷积滤波器matlab代码bfield_piv用于粒子图像测速工具链。该代码利用MatPIV工具箱执行速度场的PIV计算。大部分Matlab代码在这里执行原始图像的预处理，利用ImageJ宏以改善流中粒子的可见性，并平衡图像对之间的强度级别。设置输入结构以运行MatPIV和过滤器，然后计算速度场后处理。从PIV速度场计算其他流量统计信息，并创建人物和电影只要有可能，bfield_Piv将并行运行以大大提高性能，并将充分利用所有CPU内核，并在超级计算机的无头模式下运行。用法示例-用户输入和设置-批处理在该示例中的实验对应于海洋流体动力学涡轮的湍流尾流的PIV。这是示例中的涡轮机图像；有趣的功能包括从叶片尖端拖尾的螺旋形涡流以及尾流的扩展。这是摄影，通过PIV计算的速度场和涡度场的比较。数字要使用bfield_piv，请创建一个新目录，然后创建一个子文件夹名称“ raw”，其中包含原始相机图像。此代码运行后，将产生以下目录结构： “原始”目录包含未编辑的摄像机图像“ post”目录包含经过ImageJ处理改进后的摄像机图像，这些是执行PIV

请参考TomoKTH提供的有效实现。体层摄影PIV代码是KTH课程的一部分，推荐使用虚拟环境（Linux中使用virtualenv命令，Windows中使用Anaconda），以避免系统根源混乱。可以找到关于此主题的快速教程。在Linux中安装依赖项（如numpy，matplotlib等），可通过以下命令：$ pip search ，$ pip install 。Anaconda用户也可以找到相似的说明。资源图片以文件形式提供，请将文件保存在指定路径下，并在git中忽略以减小存储库大小。

图像直方图分析是图像处理中的重要部分，Matlab提供了强大的开发工具。

通过标签传递算法，利用Matlab实现图像连通区域的检测及物体个数的计算。

该项目利用MATLAB实现了多种图像压缩编码与解码方法，并提供详细的算法代码。项目对图像编码技术进行了全面总结，适合学习和研究图像压缩的开发者。

图像纹理分析包括统计分析法、结构分析法、频谱分析法和模型分析法。这些方法可以帮助深入理解图像的纹理特征。

这些 MATLAB 代码是用于定量分析显微镜图像的工具，重点是细菌生物膜。它们提供用于图像分割、特征提取和数据可视化的功能。这些代码已用于研究生物膜中细胞形态和行为的变化。代码已在 GitHub 上开源，包括完整源代码和使用说明。

介绍了利用主成分分析（PCA）算法实现图像压缩的MATLAB源代码。PCA是一种线性变换算法，可以将高维数据降维到低维空间中，同时保留数据的关键信息。在图像压缩中，PCA可以将原始图像表示为其主成分的线性组合，从而有效地减少图像文件的大小，而又不显著影响其视觉质量。MATLAB源代码提供了详细的分步指南，包括图像预处理、PCA分解、降维和图像重建的步骤。此外，代码还提供了可视化结果，以展示PCA在图像压缩中的效果。

本代码库提供了用于分析成肌细胞增殖图像的MATLAB脚本，这些脚本用于研究长链非编码RNA SAM(lncRNA SAM) 通过稳定Sugt1和促进动粒组装来促进成肌细胞增殖。所有代码均在 MATLAB R2014b 中测试。 代码功能： Figure6C.m & Suppl_Figure_6C.m: 计算红色通道中非零像素的平均强度，并保存输出图像。 Figure6D_Suppl_Figure_5I.m: 计算细胞核内平均绿色通道强度（蓝色），并保存输出图像。 Quantify_Figure6E_6D.m: 量化每个过滤点中平均绿色通道强度，不生成输出图像。 Visualize_Figure6E_6D.m: 生成并保存最终输出图像。 ImageCount: 用于量化Dia肌肉中胶原蛋白1的交互式软件，以及Dia肌肉上Masson's Trichrome染色中胶原阳性区域的定量。 ImageCount主要功能: 彩色图像分割和量化。 注意: 以上代码文件对应论文中相应的图像结果。