Gen3D

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Gen3D 用于构建3D基因组和染色体结构模型的工具 - 开源
Gen3D是一款应用程序,专门用于确定基因组和染色体的三维结构模型。它利用染色体接触数据来构建精确的三维染色体模型,为研究提供了重要工具。该软件由美国密苏里大学计算机科学系的程健林教授领导的生物信息学、数据挖掘和机器学习实验室开发,并得到美国国家科学基金会的支持(授权号:DBI1149224)。如果您在研究中使用Gen3D,请引用相关文献:Nowotny等人的研究结果(BMC生物信息学16,第1期,2015年)。
D3 文档
关于 D3 的中文指南
3D团块分割
利用图像导数分割密集3D组织中的细胞核。输入为一系列时间成像的z切片,格式为tiff或lsm。基于图像导数进行初级分割后,计算3D属性,并推断分割对象的图像统计数据。聚类方法解析融合的原子核为单个原子核(计算时间较长)。详情见已发表研究文章《3D胚胎成像中的对象分割和地面真相》。
Matlab代码sqrt-3D重建球形嵌入的3D重建
Matlab代码sqrt如何利用球形嵌入进行3D重建下载Aspire 0.14。从下载Aspire 0.14 Matlab代码,假设已将Aspire软件包提取到名为$ ASPIRE的文件夹中。假设3DReconstruction_SE中的文件已复制到名为$ SE的文件夹中。启动Matlab并执行以下操作:安装转到目录$ ASPIRE运行'initpath',然后运行“安装”以安装ASPIRE(只需运行一次)。初始化转到目录$ ASPIRE运行“ initpath”(每次启动Matlab会话时都需要运行)。转到目录$ SE运行“ initSEPath”(每次启动Matlab会话时都需要运行)。用模拟数据进行实验转到目录$ SE / SimulatedData运行“ produceSimulatedProjections(NumP,SNR)”,可以从以下列表中选择NumP和SNR的值运行“ testSimulatedData(NumP,SNR)”,可以从以下列表中选择NumP和SNR的值NumP信噪比100 0.2 500 0.2 1000 0.2 2000 0。
MATLAB与KINOVA Gen3 Ultra轻型机器人的适配器
该存储库包含用于将KINOVA Gen3 Ultra轻型机器人与MATLAB和Simulink集成的MATLAB适配器。有两个适配器可供使用: matlab_simplified_api适配器允许通过MATLAB与机器人通信。另一个是matlab_vision_imaq适配器,用于在MATLAB中访问Kinova视觉模块的深度和颜色流。详细安装说明和文档请访问https://github.com/Kinovarobotics/matlab_kortex/blob/master/simplified_api/README.md 和https://github.com/Kinovarobotics/matlab_kortex/blob/master/vision_imaq/README.md 。
【图像处理】DIBR-3D影像处理(3D Image Warping)matlab源码.md
【图像处理】DIBR-3D影像处理(3D Image Warping)matlab源码.md
Reconstruct3D3wayFR​ET用于N路FRET显微镜的3D重建算法
该算法用于重建N路FRET显微镜数据,生成高分辨率的三维总荧光团浓度和蛋白质-蛋白质相互作用的3D图像。
Hatsune Miku 3D Model in 3DS Max
初音模型3DMAX是基于世界知名的虚拟歌手初音未来所创建的三维模型资源,广泛用于创作音乐MV、动画、游戏、虚拟现实等项目。初音未来由Crypton Future Media公司推出,以其独特的形象和音乐风格在全球范围内拥有大量粉丝。 在3DMAX中,初音模型通常包含以下关键元素:1. 3D几何体:模型的基础,由多边形等构成,精确再现初音的身体特征。2. 纹理:增添模型色彩和质感,包括颜色贴图、法线贴图等,模拟皮肤、衣物等的质感。3. 材质:定义物体表面的光学属性,如反射和光泽,使模型更真实。4. 骨骼绑定:将模型与骨骼结构关联,实现动画效果。5. 动画控制器:提供工具创建和编辑动画,调整模型动作和表情。6. 灯光和摄像机:模拟光源,决定观众观察场景的方式。7. 渲染设置:调整抗锯齿、阴影等,生成高质量的静态图像或视频序列。 初音模型3DMAX的使用不仅限于专业设计师,也是爱好者和学习者熟悉3DMAX软件、提高3D动画技能的理想资源。通过下载并导入“小初音.max”文件,用户可以探索和编辑模型,进行个性化创作。在实际应用中,初音模型可用于游戏开发、音乐视频制作或教育环境中作为教学示例。它激发着无数创作者的灵感。
简单查看器3D简单的3D / 4D医学图像查看器-matlab开发
这是一个用于可视化来自mhd文件或ImageType格式工作区的医学图像的3D和4D查看器。其特性包括3D/4D图像可视化、图像叠加、斜切以及3D切片的可视化,还支持基本的刚性注册。推荐与医学图像处理工具箱(如下确认)一起使用。例如: >> im1 = read_mhd('BMode_ultrasound_4D.mhd'); >> im2 = read_mhd('ColorDoppler_ultrasound_4D.mhd'); >> SimpleViewer_GUI然后选择文件->从工作区打开。最新版本可在以下位置找到: https://gitlab.com/compounding/matlab
coloc3D利用MATLAB进行3D图像的双色共定位分析
此脚本允许用户将3-D TIFF图像加载到MATLAB工作区,从而实现对两个图像进行共定位分析,适用于共焦或2光子显微镜图像。脚本通过计算图像的逻辑AND来定义阈值后的共定位,并使用标签矩阵描述细胞生物学免疫标记实验中的信号粒子。它提供了多个变量,包括粒子数量、大小和强度。