在这项工作中,我们探索了一个框架,该框架有助于应用学习算法来自动提取脑部连接体。使用张量编码,我们设计了一个目标,倾向于生物学上合理的束结构。这项研究可能对正常的大脑发育和衰老、先天性异常、白细胞营养不良、肿瘤和术前计划、缺血和中风、脑病(毒性、代谢、传染性)、创伤性脑损伤、精神疾病、痴呆、抑郁症以及功能连接映射和认知神经科学产生深远影响。我们提供的演示展示了如何:(1)阶段1:使用贪婪的前向选择策略为每个体素分配方向候选集,从而初始化大脑连接组的三个二维张量,例如正交匹配追踪(OMP)或我们提出的算法称为GreedyOrientation;(2)第2阶段:建立和优化目标功能,包括提议的组调节器,以增强分册的生物学可行性。
通过组稀疏因子分解学习宏观脑连接体
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LibFM使用指南1.4.2因子分解机应用详解
libfm手册1.4.2是一份关于libfm框架的详细使用指南。该框架主要用于实现因子分解机(Factorization Machines,简称FM)模型,广泛应用于推荐系统、特征工程等机器学习领域。文档包括以下几个部分:安装、数据格式、libfm工具使用方法、学习方法和扩展模块,为用户提供了全面的操作指导。
安装
安装部分介绍了在不同操作系统(Linux、MacOSX、Windows)上安装libfm的步骤:- Linux和MacOSX:用户可下载源代码包,解压后使用GNU编译器集合和make工具进行编译。- Windows系统:用户可直接下载编译好的可执行文件,但该版本为libfm 1.4.0,虽功能与1.4.2相同,但具有不同的许可协议。跨平台兼容性:源码在GNU编译器集合上进行了测试,确保了不同操作系统间的兼容性。
数据格式
libfm支持两种输入数据格式:文本格式和二进制格式。- 文本格式:简单、易学,数据格式与SVMlight格式相同,适合新用户。- 二进制格式:适用于处理复杂或大型数据集。libfm还提供convert和transpose工具用于格式转换和矩阵转置。
libfm工具使用方法
文档描述了如何使用libfm命令行工具进行模型训练、参数设置和预测。参数设置分为:- 基本参数:用于设置学习率、迭代次数、因子数等。- 高级参数:控制正则化、学习方法细节等。libfm支持交替最小二乘法(ALS)、马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)和自适应随机梯度下降(SGDA)等方法,提供灵活性以适应不同场景。
扩展模块:块结构(Block Structure, BS)
块结构用于处理多维块的大型数据集,使libfm以更细粒度处理数据,通过块学习模型参数提高模型效率。文档提供了块结构的数据格式说明及使用注意事项。
许可证说明
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