Matlab中基础的犬类群体GLV模型的介绍,2017年4月14日,本自述文件包含能够模拟广义Lotka-Volterra(GLV)模型的软件。根据Amir Bashan,Travis E. Gibson,Jonathan Friedman,Vincent J. Carey,Scott T. Weiss,Elizabeth L. Hohmann和Liu Yang-Yu的描述,在Matlab和包含的R代码之间存在两个主要区别。首先,样本是否处于稳定状态的判定标准基于在其模型中的deltax / x的小比率,并且基于模型中的连续足够小的delta x数量。其次,该模型包含一个框架,用于对单个队列中样本之间的交互进行建模,该框架以其独立创建的方式在intraCohortInteraction.r函数中实现。数据结构样本包含三个元素的列表:丰度(abd)、增长率(gr)和互动矩阵(imat)。对于具有N种细菌的样本(例如,狗鼻中的10种细菌样本),abd和gr都是长度为N的数字向量,imat是一个N x N的矩阵。
Matlab中基础的犬类群体GLV模型终止以下代码
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犬群 GLV 模型代码终止
该 Matlab 代码是 GLV 模型的实现,它模拟了宿主生物体内的细菌种群。它具有以下特点:
使用 delta x/x 比率和连续 delta x 值确定稳定状态
考虑独立创建的样本之间的交互
Matlab
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