二阶梯度Matlab代码静态HRF反卷积和连接性分析工具箱

MATLAB代码实现了从静止状态fMRI BOLD信号中估计触发血液动力学响应的伪事件发作。基于点过程理论，使用模型检索事件与HRF发生及形状之间的最佳滞后，采用具有两个导数的规范形状或平滑的有限冲激响应。每个体素的HRF检索后，可在时间序列中对其进行反卷积以改进基于滞后的连接性估计，或映射形状参数作为病理生理指标。输入可以是3D或4D图像，或直接矩阵格式[观察x体素]。支持使用时间掩码排除特定时间点。Python软件包和BIDS-App已开发，可重复和轻松进行分析。

数据融合MATLAB代码reg_deconProject是与《自然生物技术》38.11（2020）中郭敏等人的论文相关的注册和反卷积项目的完整代码集合。该存储库包含了文章报告的大部分功能和实现，除了深度学习模块DenseDeconNet外，所有代码均可在MATLAB环境中运行。用户可查阅附加资料以获取更多详细信息，并访问存储库。发行包中已经编译了C++/CUDA库的依赖项，并提供了源代码。此外，diSPIM数据处理程序已分离到另一个独立的存储库中进行维护。

CaImAn是一种用于大规模钙成像数据分析和行为分析的计算工具箱。随着钙成像技术的发展，每周约TB的数据集正在被创建，需要高效的算法来处理。该工具箱实现了钙成像电影分析所需的基本方法，包括运动校正、电影处理、信号源和峰值提取。CaImAn特别适用于处理两光子和单光子钙成像以及行为数据集，提供了一系列高效的算法和工具。

ATRIA是R中一个快速、精确且近似的最近邻工具箱，它包含两组函数，用于计算数据集的分形或固有维数。该软件包包含实现，这是球树算法系列的一种变体，支持精确和近似的k最近邻和范围搜索。对于在高维空间中不均匀分布的点，ATRIA可能是一个不错的选择。Boxcounting方法将数据集的点合并到D维网格中，并根据点在网格框中的分布来计算各种统计信息。计算不同网格分辨率下的非空盒子的数量可以估算数据集的容量维度。

这个MATLAB工具包包含了经过严格测试的算法和源码，特别适用于毕业设计和课程设计作业。技术方面的问题随时欢迎与作者交流。

为了进行定量孪晶分析，从EBSD扫描重建的每个孪晶晶粒片段都需要具有孪晶类型、世代和母粒的特性（预缠绕）。对于小体积的双胞胎来说，这是一项微不足道的任务。然而，对于高度孪生或变形的扫描，该任务变得不那么重要。该项目的目的是利用开源工具集重新创建和改进对孪晶分析的描述，以基于孪晶分析的方法论为基础。选择MTEX是因为它在方向分析、EBSD和纹理方面具有广泛的高级工具集。需要注意的是，这需要使用Matlab才能运行提供的源代码。如果您使用此代码，请引用我们最近发表的关于Ti中的孪晶的论文。详情请参阅发布链接和DOI链接。示例和技术文档可供入门查阅。已知该源代码兼容于Matlab 2020b和MTEX版本5.4。

matlab遗传代码工具箱设置概述。该工具箱包含了我为机器学习领域编写的所有代码。软件要求主要是Python，将来可能会使用C++。工具箱内容包括分类（如Logistic回归，使用不同方法如SGD/SVRG推论LR中参数的求解器）、聚类（如Python中实现的朴素k-mean算法和在MATLAB中使用张量运算实现的SOM）、降维（如PCA）、神经网络（如在张量流中建立神经网络的Python类TFNN和多层感知器的MATLAB类MLP_SingleOutput）、以及模型选择（如用Python编写的遗传算法遵循sklearn编码样式的GA）。

MATLAB 时频分析工具箱提供了一系列用于分析非平稳信号的函数，能够揭示信号频率随时间变化的特征。该工具箱包含短时傅里叶变换、小波变换、Wigner-Ville 分布等多种时频分析方法，并支持信号可视化、特征提取以及算法开发。

提供MATLAB代码，可生成高程、坡度、长宽比数据。还包括函数文件用于计算二阶地形导数。