FSL MRI脑影像分析指南

本指南概述使用FSL软件包进行MRI脑影像分析的流程及常用工具:

1. 安装与学习资源:

  • FSL官方网站提供详细的安装教程。
  • FSL Course是深入学习FSL的优秀资源。

2. 预处理:

  • 颅骨剥离 (BET): 去除头骨及非脑组织。
  • 感兴趣区域选取 (FSLROI): 提取目标脑区。

3. 图像分割:

  • FAST: 基于模型的快速组织分割,包含偏置场校正功能。
  • Partial Volume Segmentation: 处理组织边界模糊问题,提高分割精度。

4. 结果统计与分析:

  • FSLSTATS: 提取分割结果的统计指标(如体积、平均强度等)。
  • FIRST: 皮层下结构(如海马、丘脑)的自动分割与统计分析。
  • Vertex Analysis: 基于表面的皮层形态学分析。
  • Volumetric Analysis: 基于体素的脑区体积分析。

5. 信息汇总: 整合分析结果,撰写研究报告。