MATLAB数硬币的代码通过大脑和行为的联合分解来证明脑机接口控制中的学习。该存储库包含在中再现分析所需的所有代码。探索了支持脑计算机接口学习的功能网络的中尺度组织。必选套餐所需的MATLAB工具箱:eeglab,实地考察所需的Python工具箱:os,numpy,scipy,sys;(来自的NMF)所需的R工具箱:R.matlab,ggplot2,dplyr,coin,lmPer,汽车,aplpack,RColorBrewer,wesanderson,ez,plyr。指示前处理功能连接性和行为数据非常干净,因此需要最少的预处理。运行preproc_behav.m以获取每个科目的成绩和学习率(斜率)的摘要统计信息。运行preproc_wpli和preproc_wpli_pr.m以制作FC数据和阶段随机化的FC数据。这将调用函数wrapper_wpli.m和wrapper_pr_wpli.m。该脚本将使用Fieldtrip中的一个辅助函数来组合平面梯度仪,为每个试验使用定制的辅助函数get_window_wpli.m计算wPLI,并为每个会话保存一个矩阵。
MATLAB代码用于动态功能连接分析的脑机接口研究
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为什么在许多工作中保持注意力集中至关重要,如飞行管理、技术监控和科学论文撰写?技术的发展已经使得人们能够开发方法,以保持高度的注意力水平,从而在工作中更高效地完成任务。除了专注外,这些方法还可适用于测量其他条件,如幸福或激情,以帮助个体维持适当的注意力水平。Matlab代码结合在线无模型强化学习,通过改变环境刺激,如背景音乐或视觉刺激,以促进大脑在12-18 Hz频带的额叶活动,从而帮助恢复注意力并有效工作。
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其中,IHMM基于Juergen Van Gaels IHMM工具箱构建,并通过demoIHMM.m进行演示。IWMM则通过demo_wishartMM.m进行演示,用于计算新数据集的预测可能性。
该软件已应用于已提交出版物“用于动态功能连接的模型的预测评估”的部分研究。
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dFCwalk工具箱:基于随机游走模型的动态功能连接分析
dFCwalk是一个MATLAB工具箱,用于分析从大脑活动时间序列估计的功能连接 (dFC) 的动态变化。它将dFC描述为功能网络空间中的复杂随机游走,将dFC重新配置视为结合了“流动性”和“协调性”的平滑过程。
与其他方法不同,dFCwalk不需要提取离散连接状态。工具箱提供MATLAB函数来量化dFC随机游走的特征:
dFC速度分析: 提取随时间变化的FC重新配置速率分布,用于速度或缩放分析。
元连接(MC)分析: 识别功能链接组,其波动随时间变化,并定义了真正的dFC模块,这些模块沿着特定的dFC元集线器控制器组织(区别于传统的FC模块和集线器)。对每个dFC模块进行dFC速度分析。
dFCwalk主要应用于fMRI静息状态数据,但也可扩展到其他类型的神经活动时间序列,例如局部场电位、EEG、MEG和fNIRS。
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主成分分析的matlab代码实现blgrm_cpp用于脑网络连接数据的贝叶斯低秩图回归模型李恩杰。原始模型和MATLAB实现是由密歇根生物统计系的Eunjee Lee设计和实现的。可在此处找到MATLAB实现的链接: 。 C++由密歇根大学精神病学系Sripada实验室的Andre Zapico实现。请将任何错误或问题直接发送给Andre Zapico:参数扩展贝叶斯低秩图回归模型的程序。我们提出了贝叶斯低秩图回归建模(BLGRM)框架,用于跨主题的矩阵响应数据的回归分析。这种发展是通过对跨学科、群体和时间的功能和结构连通性数据进行详细比较以及与特定行为测量的相关联系来推动的。 BLGRM可以看作是主成分分析、张量分解和回归模型的新集成。在BLGRM中,我们找到了一个通用的低维子空间来有效地表示所有矩阵响应。基于这种低维表示,我们可以轻松量化各种感兴趣的预测因子的影响,例如年龄和诊断状态,然后在公共子空间中进行回归分析,从而实现大幅降维和更好的预测。后验计算通过高效的马尔可夫链蒙特卡罗算法进行。 PX_BLGRM是对对称矩阵响应
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