明场显微图像

在matlab中使用tif图像处理，细胞之星是一款专门用于自动跟踪细胞的软件。为了研究各种生物学问题，特别是在限制细胞系制备操作和光毒性成像期间，通常采用明场成像。CellStar经过优化，能够有效分割和跟踪单层生长的出芽酵母细胞图像，同时也适用于其他圆形物体的跟踪，无论是在明场还是荧光图像中。该软件的关键在于其灵活的参数拟合机制，使其可以针对多种图像类型进行训练和应用。详细信息请访问我们的网站。

这段代码可以从SEM图像中提取纤维的直径分布数据。所有长度单位均以微米为单位。该代码会生成一个excel文件，其中包含所有测量的纤维直径。 使用该代码，您唯一需要设置的参数是图像的空间分辨率。要计算空间分辨率，请将图像的实际高度除以图像以像素为单位的高度。例如，如果图像的高度为 1000 像素，实际高度为 100 微米，则空间分辨率为每个像素 0.1 微米。 如果您在您的研究中使用了此代码，请引用以下论文： Rabbani, A. & Salehi, S. (2017). 地层动态建模损伤理论和泥饼沉积，采用过滤理论并结合 SEM 图像处理。天然气科学与工程杂志，42, 157-168.

使用Fourier Ptychography算法优化傅里叶叠层显微图像的恢复过程，以提高图像重建的精度和效率。这种技术利用多角度光学信息，通过数学模型重建高分辨率图像，适用于生物医学和材料科学领域的研究。

Matlab集成的C代码用于基于强度的组织病理学切片的明场和次谐波图像的自动配准。该代码能够自动评估和演示H&E明场图像与SHG图像的配准过程。演示版本嵌入在CurveAlign程序中，用户只需在curvealign文件夹中运行CurveAlign.m即可，无需完整安装MATLAB。

MATLAB光场工具箱LFToolbox是Donald G.Dansereau在2013-2020年间开发的工具箱，专为处理光场图像而设计。它支持光场的加载、可视化、过滤，以及基于小透镜图像的解码、校准和校正。最新版本和开发进展可在官方网站查看。详细的安装和使用说明请参考LFToolbox.pdf。

MIST是一个拼接2D图像数据集的工具，专为显微镜图像设计。它支持将时间序列数据处理为独立的数据集，并且能够处理具有10%重叠的图块。该工具的第一个版本为ImageJ / Fiji插件，未来将推出独立工具。该存储库包含两个分支：一个为插件的源代码，另一个为MATLAB原型的源代码。更新至CUDA 9.0将提升性能，特别是在现代GPU上。关于安装说明和用户指南，请参见快速导航中的相关信息。

读取tiff图像堆栈：使用Matlab函数ReadTiffStack('绝对文件名')来加载数据集，然后通过GUI界面浏览图像堆栈。这种方法允许用户方便地探索和分析延时显微镜捕获的数据序列。

这个脚本专注于利用MATLAB的内置功能，将实验显微照片分割为离散的局部状态，以支持PSP工作流程（即空间相关性）。随着时间推移，它还添加了图像预处理和分割后处理等通用材料信息学用例的功能。

直接下载并替换您明小子文件夹内的现有数据。

探索单模光纤的场分布，以应用于其传播过程中的能量分布解析。