基因簇
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clusterProfiler R包实现基因和基因簇功能分析与可视化
clusterProfiler 该软件包实现了分析和可视化基因组坐标(由支持),基因和基因簇的功能概况的方法。有关详细信息,请访问。 :writing_hand: 作者余光创(南方医科大学基础医学院)使用 clusterProfiler 时,请引用以下文章:于庚,王L,韩Y和何Q。 clusterProfiler:一个R包,用于比较基因簇之间的生物学主题。OMICS:综合生物学杂志*。 2012,16(5):284-287。
统计分析
0
2024-11-06
聚簇索引-SQL语言基础
聚簇索引在SQL语言中是指根据索引列对数据进行物理排序,类似于电话号码簿中按姓氏排列数据。每个表只能有一个聚簇索引,但一个索引可以包含多个列。
SQLServer
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2024-08-01
基因算法与函数优化
基因算法是模拟达尔文生物进化理论的计算模型,通过模拟自然进化过程来搜索最优解。它起始于一个代表问题解集的种群,每个个体都带有基因编码的特征。染色体作为主要的遗传载体,内部表现为某种基因组合,决定个体的外部表现特征,例如黑发。
算法与数据结构
2
2024-07-27
磷循环基因分析过滤代码
磷循环基因数据库 (PCyCDB)
PCyCDB 数据库包含 138 个基因家族和 10 个代谢过程,并添加了同源基因以降低假阳性率。
通过识别已知的模拟基因数据集和模拟细菌群落,优化了序列相似性搜索工具(例如 BLAST、USEARCH、DIAMOND)生成的比对结果的过滤标准(即同一性、匹配长度),以获得最佳准确性和进一步降低假阳性。
数据挖掘
2
2024-05-12
Oracle数据库中簇表详解
在Oracle数据库中,簇表是一种存储方法,允许多个表共享同一数据块中的某些公共列。这些表上具有相同值的公共列的数据行将存储在同一数据块中。因此,簇表可以提高某些查询的性能,尤其是涉及多个表和公共列连接的查询。
需要注意的是,Oracle中的簇表与SQL Server中的聚集索引不同。SQL Server中的聚集索引按索引键的存储顺序强制行存储,类似于Oracle中的索引组织表(IOT)。
Oracle
2
2024-05-30
SQL语言基础中的聚簇索引
聚簇索引是指数据按索引列进行物理排序,类似于电话号码簿中按姓氏排列数据的方式。每个表只能有一个聚簇索引,但一个索引可以包含多个列。
SQLServer
1
2024-07-29
生物信息学中基因表达与基因对分析的C++实现
生物信息学领域中,基因表达和基因对分析对于肿瘤研究至关重要。详述了如何利用C++编程语言进行基因对的两两配对,并计算在肿瘤和正常样本中出现反转配对的基因。我们讨论了C++在生物信息学中的应用、基因表达的原理以及基因对分析的具体方法。C++因其高效性和性能优势,在处理大规模基因数据时具有明显优势。基因表达和反转配对分析可以帮助识别出肿瘤相关的关键基因对,为后续的病理研究和药物靶点筛选提供重要线索。
数据挖掘
0
2024-09-14
SciDB 基因 + 现象数据分析范例
SciDB 笔记本展示使用 SciDB 处理基因型 + 表型数据集,包含简单的聚合和高级计算。该工作基于 SciDB 的横向扩展功能和复杂数学计算能力。
统计分析
5
2024-05-13
关系型数据库表与表簇
Oracle 11g R2 数据库中表和表簇的概念
Oracle
3
2024-05-30
SQL语言基础非聚簇索引的优势
数据表中的非聚簇索引与数据分开存储,通过指针引导到数据存储的位置。索引项按键值排序,而表中数据则以另一种方式组织,这类似于图书的目录结构。
SQLServer
2
2024-07-26