细胞检测

Matlab代码博客细胞检测的高效算法

尽管物体检测已在多个行业产生影响，但在使用巴氏涂片显微镜检测癌细胞方面仍存在挑战。本项目引入了一种机器学习算法，能够在检测和裁剪感兴趣区域（ROI）之前自动检测异常细胞特征。使用宫颈细胞的数字图像，我们通过以下三个关键步骤实现ROI的自动识别：（I）应用于RGB显微照片的非线性过滤器；（II）基于图的聚类（Felsenszwalb算法）；（III）Isodata二进制分类定义超像素。该过程的平均精度达到92%，平均召回率为95%。这一算法是未来智能显微镜电动载物台的核心驱动力，能够扫描完整的载玻片。详见Efficient_Graph_Poster_19.pdf。

Matlab 2 2024-07-22

Matlab细胞-支架接触检测源码库

这个存储库包含了用于从细胞和支架荧光z堆栈中检测细胞-支架接触的源代码。算法包括基于统计模型的细胞分割（Java 1.8）、基于平面几何模型的纺粘涂层和基于圆柱几何模型的纤维支架分割（Matlab 2015a）、以及骨骼和直径提取（C++）。这些算法支持生物学假设验证、成像描述和数据分析。

Matlab 0 2024-08-25

Matlab Hill代码RBCNet双重深度学习架构用于细胞检测

Matlab Hill代码RBCNet采用双重深度学习架构，改善生物医学应用程序中的细胞检测任务，提升手动分割和注释的准确性和可重复性。该算法包括U-Net和Faster R-CNN两阶段，分别用于单元群集分割和小型单元对象检测。RBCNet通过单元聚类技术实现区域检测，提高了在稀薄涂片显微镜图像中的精确度和扩展性。

Matlab 0 2024-09-26

MATLAB AMI代码基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序细胞类型检测

这篇论文提供了一种基于深度双随机图正则化矩阵分解的方法，用于单细胞RNA测序中的细胞类型检测。编码使用MATLAB实现，主要包括 run_DSINMF.m、factorization_AB.m、factorization_BF.m、constructW.m、NormalizeUV.m、bestMap.m、compute_NMI.m、AMI.m 和 ARI.m 等文件。用户需下载DSINMF文件夹，并参照README.doc进行操作。

Matlab 0 2024-08-08

流式细胞术在乳腺癌患者循环肿瘤细胞检测中的应用一项盲研究

循环肿瘤细胞是从原发肿瘤处分离并迁移到骨髓或其他组织的细胞，能够启动远处转移。近几十年来，液体活检成为新兴工具，用于检测患者血液中的循环肿瘤细胞。流式细胞仪作为液体活检诊断的重要工具，本研究通过健康个体样本作为对照，盲目地评估其在乳腺癌患者中CTC检测的敏感性和特异性。统计分析结果显示，曲线下面积达到86.9％，表明该方法在乳腺癌诊断中具有显著前景。

统计分析 0 2024-09-13

Matlab细胞轨迹跟踪代码

此存储库包含用于Matlab的灰度处理和细胞跟踪的源代码。该程序支持荧光或暗场电影的处理，以及相衬电影的跟踪。兼容Matlab 2018a及更早版本，支持'.tif'堆栈和'.nd2'文件格式。还提供适用于Linux的版本。

Matlab 0 2024-08-12

LC3B ROI量化：细菌感染细胞图像分析和细胞内信号提取

此函数以16位TIFF堆栈形式接收图像，并通过解交错处理其三个通道。它对核标记和病原体通道进行阈值处理和分水岭分割，以识别细胞核和细菌。然后，该函数使用病原体质心创建目标区域（ROI），并通过子图像提取病原体周围的细胞内信号。

Matlab 3 2024-05-31

【细胞分割】基于分水岭算法的细胞分离计数matlab程序及GUI.zip

【细胞分割】基于分水岭算法的细胞分离计数matlab程序及GUI.zip

Matlab 0 2024-08-22

深蓝-搜狗细胞词转换器

深蓝是搜狗细胞词转换工具，可从搜狗细胞词网站获取领域和类别词。转换格式后，可使用深蓝将文件转换为 Excel 等其他格式，方便处理和使用。

算法与数据结构 5 2024-05-25

使用Phagosight追踪巨噬细胞MATLAB开发

用于重叠巨噬细胞分析的MATLAB软件包。

Matlab 1 2024-08-01