PCR

Matlab应用-PCR效率优化。用于相对定量转录的逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）的效率调整和优化。

数字电视广播系统中，节目复用器和传输流再复用器是不可或缺的组件。节目复用器负责将编码后的视频基本流（ES）、音频基本流、节目描述信息（PSI）和辅助数据按照MPEG-2系统层标准复用为传输流。为了确保接收端同步工作，系统时钟（STC）计数器的值将插入到PCR字段中。根据传输流中的节目数，分为单节目传输流（SPTS）和多节目传输流（MPTS），相应地有单节目复用器和多节目复用器。传输流再复用器将不同来源的传输流合成为新的传输流，并插入数据广播、电子节目指南（EPG）、条件接收（CA）等服务信息。PCR校正是复用器的核心技术之一，用于确保发端时钟的准确注入和接收端的无偏差恢复，对系统性能至关重要。详细介绍了PCR校正技术的重要性和应对的挑战。

MATLAB代码用于从Excel文件读取实时PCR机器的原始数据。编写的代码能够在不同计算机上读取AB7500系统的输出，前提是Excel文件格式相同。电子表格中，Col A代表孔号，Col B是检测器，Col C是样品名称，Col D及以后列则显示循环数。每个井的荧光值减去基线（7500系统软件的DRn）用于分析。循环编号需以文本格式呈现，井号必须是数字，而检测器和样品名称列必须是文本格式。这种数据处理方法半自动化，需要确保每个井的LRE窗口准确定位，确保从扩增曲线的线性部分开始，并结合标准曲线或ΔΔCT。

这段MATLAB代码实现了快速主成分回归（PCR）。您可以下载fastpcr.m，lanczos.m，ridgeInv.m和robustReg.m，或直接将它们包含在项目目录中。主成分回归（PCR）是一种常见有效的正则化线性回归形式。它通过计算限制在A的顶部奇异矢量跨越的空间内的解决方案来解决标准线性回归问题。fastpcr通过矩阵多项式方法（显式或隐式的Lanczos方法）完全避免了标准特征分解的计算瓶颈。