转录组

Recital 众包平台用户在众包模式下完成的转录数据的整合。

这个存储库包含用于支持神经认知基因转录映射的脚本、函数和数据。预印本、后印本和文章可在此找到。所有分析均在Matlab版本9.8.0.1359463（R2020a）Update 1上完成，数据和脚本分为五个子文件夹。主要分析文件夹PLS包含部分最小二乘分析的脚本，用于基因表达和功能激活矩阵。

详细介绍了利用宏基因组数据组装某物种基因组的整个流程，包括数据预处理、三种不同组装工具的应用（Minia、SPAdes和Megahit），以及组装结果的评估和比较。首先进行宏基因组数据的预处理，包括参考基因组的比对、reads的提取和过滤。随后使用Minia、SPAdes和Megahit进行基因组组装，分别介绍了它们的特点和适用情况。最后通过Quast评估组装结果，比较了三种工具的效果。为利用宏基因组数据进行某物种基因组组装提供了详细指南。

MySQL参数选项组配置了MySQL客户机程序mysql.exe可以读取的参数信息。常用的参数包括“prompt”和“default-character-set=gbk”。修改“ [mysql] ”参数选项组中的参数值会直接影响新打开的MySQL客户机。

我们在Pure Data（PD）中实现了音频鼓转录算法，该算法可以从现场鼓演奏中转录踢、军鼓和踩-。该软件将现场音频或文件作为输入，并输出每种鼓类型的事件。Pure Data修补程序和某些Pure Data外部组件的源代码均已根据GPL许可进行分发。为了使用此应用程序，您将需要安装Pd扩展的可视编程环境。建议使用最新版本。您可以通过加载DEMO补丁立即开始使用该软件。如果选择重新合成按钮，则演示程序将转录音频并提供同时的音频反馈。代表转录的踢、圈套或踩-的MIDI音符可以发送到所需的通道。如果您具有一些非常基础的Pure Data知识，则可以通过修改补丁来满足您的需求。该算法会准实时发送每个新的踢、军鼓和踩-事件的爆炸消息。该应用程序是模块化的，并为不同版本提供了单独的补丁程序，您可以自定义构建鼓转录系统。

分布式集群环境下使用的组件： Hadoop2.7.7Hive2.3.6HBase1.3.0Zookeeper3.4.6Jdk1.8+

基于 MATLAB，可求解方程组 ax=b，其中 m > n。

本教程介绍了使用MATLAB计算和绘制S域系统的组延迟的方法。

线性方程组由若干个含多个未知量的线性方程组成，可表示为矩阵形式：Ax = β。其中，A为系数矩阵，x为未知量向量，β为常数向量。如果方程组有解，则称其为相容的，否则为不相容的。齐次线性方程组（所有常数项为零）总有解。

MATLAB 使用 Runge-Kutta-Fehlberg 方法解 ODE 问题，以有限个点进行计算，点间距由解本身决定。 可使用 ode23 求解 2-3 阶常微分方程组，使用 ode45 使用 4-5 阶 Runge-Kutta-Fehlberg 方法。 例如，在命令行中使用 ode45 函数代替 solver，其中 x' 是 x 的微分，而非 x 的转置。