chan算法MATLAB代码:随机生成stochGENESIS神经模拟器的随机离子通道

chan算法用于 随机生成stochGENESIS神经模拟器 中的随机离子通道,改编自以下出版物的代码:

  • Ca2+微区中钙激活钾电流的随机放大” (J Computational Neurosci)。
  • 海马中间神经元的突触类噪声活动” (T-Space论文)。

运行 stochGENESIS

  1. 运行预编译的二进制文件:可选择运行现有的二进制文件,或在安装 GENESIS 2.3 后自行编译stochGENESIS。

    • 适用于 64位LinuxOS X 系统的预编译文件分别在 bin_linuxbin_Mac 文件夹中提供。
    • 使用命令: bash cd bin_linux # 或者 cd bin_Mac ./binsetup cp .simrc ~ export PATH=$PATH:`pwd` ./stochgenesis
  2. 编译 stochGENESIS:若希望自行编译,请参考 GENESIS 2.3 参考手册的“自定义GENESIS”部分进行操作。

pore模块与随机通道生成

该代码的核心功能之一在于使用 pore模块 来支持随机通道生成,从而实现更精细的神经元噪声模拟与建模。通过增加噪声参数,您可以生成逼真的钙激活钾电流效应。