Matlab kpca程序 Matlab.v1.7-beta.1中的神经元轨迹重建实用程序,当前修订版日期为2020年11月24日。根据MIT许可条款,由Emili Balaguer-Ballester等人撰写。代码引用:E. Balaguer-Ballester,R. Nogueira,Abofalia,JM,Moreno-Bote,R. Sanchez-Vives,MV,2020。眶额皮质三重态相互作用的可预见选择结果的表示。Plos Comput Biol,16(6):e1007862。以前的版本:Lapish,C.和E. Balaguer-Ballester(共同第一作者),Phillips,A,Seamans,J.和Durstewitz,D.2015。苯丙胺在工作记忆期间双向改变前额叶皮层吸引子动力学。神经科学杂志35(28):10172-10187。Balaguer-Ballester,E.,Tabas-Diaz,A.,Budka,M.,2014年。我们能否确定试
Matlab KPCA for Neuronal Trajectory Reconstruction
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在本项目感染_网络_重建中,您需要使用MATLAB软件来解决优化问题,才能运行大部分脚本。关键脚本和函数如下:
figs_paper.m:生成论文中的所有图形(不包括原理图)
example_reconstruction.m:此文件是重建示例,建议从此文件开始
predictor_prey_integrator.m:中心函数之一,负责集成动态
fun_net_recons.m:以离散间隔测量动态,使用cvx重建感染网络矩阵M
图形脚本说明
Fig1 - 使用example_reconstruction.m生成
Fig2 - 通过delta_equi_error.m生成
Fig3 - 原理图,无脚本
Fig4 - 无脚本
Fig5 - 使用multi_vs_single.m生成
Fig6 - 通过nExp_error.m生成
Fig7 - 通过噪音.m生成
Fig8 - 生成步骤包含steps_tfinal_recons.m和fixed_nMeas.m
每个图形都对应独立的脚本,方便执行计算并保存数据。
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make ripser-coeff
Once these steps are complete, you can run the provided examples:
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精度检验流程
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