seir的MATLAB代码重新设定对群体免疫和持续SARS-CoV-2传播的期望论文的支持代码目录。
关于代码
此存储库中的代码允许重复和独立分析Felix Wong和James J. Collins在论文“重置对群体免疫和持续SARS-CoV-2传播的期望”中描述的内容。该代码需要MATLAB 2019b或更高版本才能运行。
运行代码
在主文件夹中,有MATLAB脚本用于再现正文中详述的传输网络模型:
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no_exogenous_infections.m
该文件是主要的模拟脚本,生成BA或WS随机图并运行正文中描述的SEIR模拟,不考虑任何外源性感染。
(对于完整的图,使用ones()函数生成邻接矩阵。)
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exogenous_infection.m
该文件是对主要模拟脚本的改编,考虑了任何外源性感染。假设图模型已经生成,邻接矩阵存储在变量A中。在运行no_exogenous_infections.m之后运行它以确保正确存储图形模型。考虑到随机接种的情况,取消注释相应的代码行。
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SEIR.m
该文件模...