cryo3d是基于MATLAB的软件,可快速进行3D蛋白质重建,基于深冷粒子图像。该软件在耶曼医学院放射诊断学系的监督下开发,由Hemant Tagare教授参与。

项目结构:

- /doc:与项目描述相关的文档。

- /script:管道和主要工作区的主要.m脚本(MATLAB应从该文件夹运行)。

- /src:包含不同管道布置步骤的.m功能,例如预处理、best_match等;mrc文件夹包含读写.mrc文件的功能。

- /test*:正在开发的临时函数,可能会在最终发行版中删除。

要下载管道的源代码,请运行以下命令:

git clone https://github.com/vicrucann/cryo3d
cd cryo3d
git submodule update --init --recursive

运行整个管道时,用户必须提供配置文件作为script\cryo3d.m函数的输入。您可以在script文件夹中找到适用于Windows和Linux的示例文件。