我们介绍了一些专为MATLAB环境编写的基本程序,用于光学、声学数据和信号处理的复杂数据分析。这些程序基于理论物理方法的新概念,提供专家用户定制的功能。其中,前两个程序执行KK关系的计算,第三个程序用于根据Kramers-Kronig关系获取实部和虚部的敏感性自洽估计。第四和第五个程序则处理单调Kramers-Kronig关系的计算。建议用户将这些程序统一存放在同一目录下,文件命名如下:程序一:kkimbook2.m;程序二:kkrebook2.m;程序三:selfconsbook2.m;程序四:sskkimbook2.m;程序五:sskkreboo。
光学、声学、信号处理数据分析工具MATLAB开发的简易软件包
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CIAtah软件包钙成像数据集分析的新工具
CIAtah(发音为cheetah;以前是calciumImagingAnalysis [ciapkg])是用于对单光子和双光子成像数据集进行钙成像分析的软件包。最新代码可在GitHub上找到:https://github.com/bahanonu/calciumImagingAnalysis。请参阅GitHub或https://git.io/ciapkg_docs获取详细自述文件和信息。软件包包括GUI,允许用户执行大规模批处理分析,可通过存储库中的“calciumImagingAnalysis”类访问。还提供命令行就绪的分析管道。主要功能包括预处理、细胞提取、细胞分类等。此外,还包括用于动物位置确定的代码。
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功能
2D 和 3D SMLM 数据分析算法:
基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN)
基于 Voronoi 的聚类分析
里普利函数
径向分布函数 (RDF)
最近邻分析 (NN)
距离分析
用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText)
数据可视化
具有批处理功能的用户界面
软件获取与安装
下载软件包并解压缩 LAND-master.zip 文件。
将生成的 LAND-master 目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。
在 MATLAB 命令窗口中,导航到 LAND-master 目录并运行 LAND 启动软件。
文档和示例
有关如何使用该软件的详细说明(包括示例),请参阅软件包中的文档。
系统要求
MATLAB R2014b 或更新版本
统计和机器学习工具箱
图像处理工具箱(可选,但强烈建议用于更快的计算)
建议至少 8 GB RAM
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