该脚本用于在高分辨率下量化单个细胞水平的自噬泡。LC3B Tandem Puncta QuantificationV2是一个批处理工具,用于识别eGFP和mCherry信号标记的LC3B液泡,专为自噬研究人员设计。数据要求为多维tiff堆栈或ND3文件,包含eGFP、mCherry和核标记三个通道。测试数据使用共聚焦显微镜采集,以确保高质量的结果。
Matlab灰度处理脚本LC3B Tandem Puncta量化
相关推荐
LC3B ROI量化:细菌感染细胞图像分析和细胞内信号提取
此函数以16位TIFF堆栈形式接收图像,并通过解交错处理其三个通道。它对核标记和病原体通道进行阈值处理和分水岭分割,以识别细胞核和细菌。然后,该函数使用病原体质心创建目标区域(ROI),并通过子图像提取病原体周围的细胞内信号。
Matlab
3
2024-05-31
DIIVINE神 - Matlab图像灰度处理脚本
Matlab在图像处理领域的灰度处理功能非常强大。通过简单的DIIVINE脚本,可以轻松实现图像的精确灰度调整和优化,提高处理效率和质量。这个脚本不仅简化了处理步骤,还提供了灵活的参数调节选项,适用于各种图像处理需求。
Matlab
2
2024-07-27
Matlab正弦信号ADC量化仿真脚本
Matlab脚本用于生成正弦信号并通过简单ADC量化,以展示量化过程。函数输入包括电压工作范围、量化位宽和输入向量,输出包括量化前后波形对比和量化误差绘图。
算法与数据结构
2
2024-07-13
Matlab灰度图像伪彩色处理方法
在图像处理中,灰度图像常常需要转换成伪彩色来进行更清晰的分割与分析。使用Matlab中的伪彩色变换函数,可以将灰度图像的灰度级映射到颜色空间中,进而使图像的细节更易于观察与处理。此方法在医学成像、遥感图像等领域有广泛应用。
Matlab
0
2024-11-06
生成涡旋光相位灰度图的Matlab脚本
在Matlab中编写脚本,生成用于加载空间光调制器的涡旋光相位灰度图。这种灰度图可用于产生涡旋光等特定光学效果。
Matlab
0
2024-09-30
Matlab图像处理脚本
这里提供一些简单易懂的Matlab图像处理代码,特别适合初学者使用。这些代码可以帮助您快速入门,理解图像处理的基本原理和操作方法。
Matlab
0
2024-10-01
Matlab图像处理中的灰度直方图计算
灰度直方图的计算依据定义,对于大小为MxN的灰度图像f(x,y),其灰度级别为L(通常L=256),可以通过初始化hist[k]=0; k=0,…,L-1来获得。然后统计每个灰度级别的像素数目,使用Matlab函数imhist()进行实现。
Matlab
0
2024-10-01
Matlab BOPS批处理OpenSim处理脚本
BOPS(批处理 OpenSim 处理脚本)执行常见 OpenSim 程序(逆运动学 -IK,逆动力学 -ID,肌肉分析 -MA,静态优化 -SO 和 关节反应分析 -JRA)的批处理,并将输出、日志记录信息、设置文件和曲线图存储在文件夹的有序结构。我们使用 OpenSim API 实现了 BOPS,这些 API 通过设置文件接收以下信息:(i)每个标记的名称和权重(IK);(ii)外部负载(ID);(iii)感兴趣的肌肉和力矩臂(MA);(iv)静态优化条件和肌肉执行器负载(SO);(v)感兴趣的关节(JRA)。用户负责为其数据定义适当的配置,但我们已为每个安装文件提供多个模板,以加快自定义。可使用 MATLAB 图形用户界面(GUI)来简化过程的执行。在选择安装文件时,不限制使用 GUI。用户还可以输入:(i)执行的 OpenSim 程序;(ii)要处理的试验;(iii)用于仿真的 OpenSim 模型;(iv)滤波的截止频率;(v)要绘制的输出变量和 x 轴标签。 BOPS 将其输出存储在自动创建的文件夹中。这些文件夹完美地集成在 MOtoNMS 软件中。
Matlab
0
2024-11-04
MATLAB图像处理算法优化-灰度转换技术
这是一个基于MATLAB的图像处理项目,重点是灰度转换技术的优化实现。该项目包含了非线性转换、分段线性转换和线性转换等多种灰度转换算法的程序代码及测试图片。通过优化这些算法,可以显著提升图像处理的效率和质量。
Matlab
2
2024-07-27