使用DICOM RT进行医学图像的3D语义分割

利用图像导数分割密集3D组织中的细胞核。输入为一系列时间成像的z切片，格式为tiff或lsm。基于图像导数进行初级分割后，计算3D属性，并推断分割对象的图像统计数据。聚类方法解析融合的原子核为单个原子核（计算时间较长）。详情见已发表研究文章《3D胚胎成像中的对象分割和地面真相》。

这是一个用于可视化来自mhd文件或ImageType格式工作区的医学图像的3D和4D查看器。其特性包括3D/4D图像可视化、图像叠加、斜切以及3D切片的可视化，还支持基本的刚性注册。推荐与医学图像处理工具箱（如下确认）一起使用。例如： >> im1 = read_mhd('BMode_ultrasound_4D.mhd'); >> im2 = read_mhd('ColorDoppler_ultrasound_4D.mhd'); >> SimpleViewer_GUI然后选择文件->从工作区打开。最新版本可在以下位置找到： https://gitlab.com/compounding/matlab

此脚本允许用户将3-D TIFF图像加载到MATLAB工作区，从而实现对两个图像进行共定位分析，适用于共焦或2光子显微镜图像。脚本通过计算图像的逻辑AND来定义阈值后的共定位，并使用标签矩阵描述细胞生物学免疫标记实验中的信号粒子。它提供了多个变量，包括粒子数量、大小和强度。

介绍了如何使用K-mean算法对DCM医学图像进行聚类分割，并提供了样例图以及可直接运行的代码。如果您觉得有用，请及时评论，为后来者提供参考。

这对于处理时需要将3D图像转换为2D图像进行配准的情况非常有用，例如基于地标的薄板样条方法。

该方法包括以下功能： 图像重新定向 (imstack_reorient)：辅助或自动将3D图像堆栈重新定向到所需的参考框架。 图像去旋转 (imstack_derotate)：将重新定向后的堆栈旋转回原始参考系，使选择区域与原始图像对齐。 通过这种方法，可以一致地执行感兴趣区域选择，而不会在图像分析中引入插值误差。

【图像处理】DIBR-3D影像处理（3D Image Warping）matlab源码.md

利用Matlab进行简单螺旋弹簧的三维旋转、平移变换，并将结果保存为JPG格式。

MATLAB可用于初学者对CT图像中的肾脏部分进行提取和分割。这为初学者提供了了解肾脏分割基本信息的机会。