Casey, JR和Follows, MJ在2020年的研究中提供了一个灵活且易于使用的Matlab代码,用于微生物在养分限制条件下的稳态模型。他们应用这一模型于大肠杆菌K12 BW25113,探索了在葡萄糖限制与充足条件下的生长模式。该代码基于最新的大肠杆菌K12 MG1566基因组规模代谢模型(iML1515),能计算多种关键参数,如n、n max、S、Sl lb、S ub、v max G、v D、μ max等。该代码在Matlab 2019b下运行无误。如果您有兴趣将此模型应用于其他微生物或不同的运输过程,请访问GitHub仓库https://github.com/jrcasey/NutrientUptake获取更多信息。
Matlab代码示例-NutrientUptakeCaseyandFollows,2020
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