使用MATLAB进行图像配准时，通过计算图像的互信息值来评估配准质量。首先，载入需要配准的基准图像和待配准图像。然后，选择合适的配准参数，如使用'imregister'函数，设置'metric'为'normxcorr'，'transformType'为'rigid'，'optimizer'为'imregconfig'。最后，根据配准后图像的互信息值来量化两幅图像的相似度，互信息值越大，说明两幅图像的相似度越高。