基于MATLAB的成肌细胞增殖图像分析

TIMP-1过表达载体转染BEL-7402细胞，MTT和细胞生长曲线实验显示，TIMP-1能抑制BEL-7402细胞增殖。

这个存储库包含用于3D单细胞分割和分析的Matlab代码，附有详细的步骤说明。分割分段器是一个用于Matlab的应用，通过阈值化细胞质标记物或膜标记物的分水岭转换，在3D空间中精确分割细胞。用户界面简单易用，允许调整参数以达到最佳分割效果。分析脚本可应用于图像文件夹，并将结果保存为Excel文件，包括通道的阈值识别点和区域的富集和部分重叠分析。

利用Matlab开发的算法可以有效识别和定位癌细胞，为医学研究提供了重要工具。

此函数以16位TIFF堆栈形式接收图像，并通过解交错处理其三个通道。它对核标记和病原体通道进行阈值处理和分水岭分割，以识别细胞核和细菌。然后，该函数使用病原体质心创建目标区域（ROI），并通过子图像提取病原体周围的细胞内信号。

【细胞分割】基于分水岭算法的细胞分离计数matlab程序及GUI.zip

MV-LEAP基于多视图学习的数据增殖器，处理Olfa Graa创建的高度不平衡的类，以促进分类任务。详细信息请查阅。该框架已在2019年神经科学方法杂志上发表。MV-LEAP包括两个关键步骤：解决训练数据不平衡的问题，提出基于流形学习的增殖器；解决多视图数据异质性学习的问题，提出利用张量规范相关分析的多视图流形数据对齐方法，将原始和增殖视图映射到共享子空间中以对齐目标分类任务的分布。MV-LEAP源代码已在Matlab R存储库中发布，用于模拟异构多视图数据集的训练和测试。

提出了一种基于阙值、边缘、形态学和种子点的细胞图像分割方法。该方法将图像二值化，提取边缘，并应用形态学操作来填充孔洞并去除噪声。然后，通过种子点选择和区域生长来分割细胞。该方法实现了鲁棒和准确的细胞分割，可用于各种细胞图像。

灰度共生矩阵：图像纹理分析利器 灰度共生矩阵 (GLCM) 是一种用于分析图像纹理的强大工具，它通过研究图像中像素对的灰度关系来描述纹理特征。 核心原理： GLCM 统计图像中具有一定空间关系的像素对的灰度值组合出现的频率。例如，它可以计算在特定距离和方向上，灰度值为 i 的像素与灰度值为 j 的像素同时出现的次数。 方向与距离： 通常，GLCM 会在 4 个主要方向上计算 (水平、垂直、45 度对角线、135 度对角线)，并且可以根据纹理特征选择不同的步长距离。 纹理特征提取： 通过 GLCM 可以计算多种纹理特征，常见的包括： 能量： 反映图像灰度分布的均匀程度和纹理的粗细度。 熵： 度量图像纹理的复杂程度，熵值越大，纹理越复杂。 相关性： 表示图像纹理的方向性。 对比度： 反映图像的清晰度和纹理沟壑的深浅。 MATLAB 实现： MATLAB 提供了强大的图像处理工具箱，可以方便地计算 GLCM 和提取纹理特征。 应用领域： GLCM 在图像分类、目标识别、医学图像分析等领域有广泛应用。

在matlab中使用tif图像处理，细胞之星是一款专门用于自动跟踪细胞的软件。为了研究各种生物学问题，特别是在限制细胞系制备操作和光毒性成像期间，通常采用明场成像。CellStar经过优化，能够有效分割和跟踪单层生长的出芽酵母细胞图像，同时也适用于其他圆形物体的跟踪，无论是在明场还是荧光图像中。该软件的关键在于其灵活的参数拟合机制，使其可以针对多种图像类型进行训练和应用。详细信息请访问我们的网站。