基于MATLAB的成肌细胞增殖图像分析

TIMP-1过表达载体转染BEL-7402细胞，MTT和细胞生长曲线实验显示，TIMP-1能抑制BEL-7402细胞增殖。

这个存储库包含用于3D单细胞分割和分析的Matlab代码，附有详细的步骤说明。分割分段器是一个用于Matlab的应用，通过阈值化细胞质标记物或膜标记物的分水岭转换，在3D空间中精确分割细胞。用户界面简单易用，允许调整参数以达到最佳分割效果。分析脚本可应用于图像文件夹，并将结果保存为Excel文件，包括通道的阈值识别点和区域的富集和部分重叠分析。

利用Matlab开发的算法可以有效识别和定位癌细胞，为医学研究提供了重要工具。

Matlab代码不反应问题常见于复杂的细胞动力学仿真，尤其是在应用pCellDynasts方法解决鳞状上皮组织增殖细胞的动力学时。此方法揭开鳞状上皮组织中细胞增殖范式的计算方式，允许对增殖细胞类型、更新动态以及谱系命运的安排进行推断，确保组织的动态平衡。通过此方法，研究人员能够利用实验数据推断细胞命运，进一步优化组织模型的精确度。 主要功能模块 H2BGFP-ModalityTests: 该模块通过模态测试推断细胞增殖异质性，进行多模态统计分析，揭示分裂速率的同质性，进而推测增殖细胞的类型数量。 H2BGFP-tcc-In: 该模块用于推断和拟合实验数据，支持跨细胞层面的增殖模型仿真，并能有效展示不同细胞类型的动态行为。 详细上下文和原始出版物可以参考：Piedrafita G, Kostiou V, Wabik A, et al. (2020). A unified model of skin and esophageal epithelium maintenance. Nat Commun 11, 1429. 该工具有潜力扩展应用于其他组织中增殖细胞的层次结构和更新模式的研究。

此函数以16位TIFF堆栈形式接收图像，并通过解交错处理其三个通道。它对核标记和病原体通道进行阈值处理和分水岭分割，以识别细胞核和细菌。然后，该函数使用病原体质心创建目标区域（ROI），并通过子图像提取病原体周围的细胞内信号。

【细胞分割】基于分水岭算法的细胞分离计数matlab程序及GUI.zip

MV-LEAP基于多视图学习的数据增殖器，处理Olfa Graa创建的高度不平衡的类，以促进分类任务。详细信息请查阅。该框架已在2019年神经科学方法杂志上发表。MV-LEAP包括两个关键步骤：解决训练数据不平衡的问题，提出基于流形学习的增殖器；解决多视图数据异质性学习的问题，提出利用张量规范相关分析的多视图流形数据对齐方法，将原始和增殖视图映射到共享子空间中以对齐目标分类任务的分布。MV-LEAP源代码已在Matlab R存储库中发布，用于模拟异构多视图数据集的训练和测试。

提出了一种基于阙值、边缘、形态学和种子点的细胞图像分割方法。该方法将图像二值化，提取边缘，并应用形态学操作来填充孔洞并去除噪声。然后，通过种子点选择和区域生长来分割细胞。该方法实现了鲁棒和准确的细胞分割，可用于各种细胞图像。

在MATLAB中，开发与红细胞增多症相关的分析工具，可以通过编写相关函数来实现疾病的诊断与监测。劳斯的象征性政策阵列可以用于该领域的算法开发，提供不同的函数实现来处理血液数据。在MATLAB Central中，您可以找到多种类似的函数和工具，帮助分析红细胞增多症的相关数据，增强开发效率与准确度。