微生物多样性

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WHO微生物分析系统
WHO微生物分析系统提供数据统计、计算、图表功能,并支持数据导出至Excel。
哈尼族传统林业知识与森林生物多样性
本研究通过野外调查和统计分析,揭示了哈尼族传统林业知识对森林生物多样性的影响。结果表明,哈尼族传统林业知识影响了其聚居区周边森林的群落结构和乔木物种多样性。私有承包林拥有最高的乔木物种多样性,神林保留了更多的本地树种,并成为野生动植物的避难所。
microbial:基于dada2和phyloseq的微生物组分析
microbial是一个R软件包,用于分析和可视化16S rRNA数据,增强了R中微生物群落分析的功能。它利用dada2和phyloseq进行分析,简化了分析流程。 使用方法和数据要求 microbial支持两种数据输入方式: 原始fastq文件: 需同时提供样品信息。 phyloseq对象: 包含分类群丰度信息、分类法分配、样品数据(环境变量、分类变量等)。系统发育树信息可选,但目前大多数功能不需要。 推荐使用phyloseq对象,因为它为分析和可视化提供了更多选项。 详细格式参考phyloseq对象文档。 示例数据 physeq数据包含每个样本中数百万个16S rRNA序列的多样性信息。
活动的多样性-决策树技术
活动的多样性包含两个属性值:进行和取消。其熵值为: H(活动) = - (9/14)log (9/14) - (5/14)log (5/14) = 0.94。
缙云山草珊瑚群落植物多样性及影响因素分析
通过双向指示种分析法, 将缙云山草珊瑚生存群落划分为 7 个群丛, 并阐述了各群丛类型特征。采用样方法统计分析其多样性, 并应用丰富度指数 (R1)、Shannaon-Wiener 指数 (H) 和均匀度指数 (E1) 对 7 个群丛的植物物种多样性进行了研究。 研究发现,群丛植物物种多样性指数受立地生境和人为活动共同影响。7 个群丛植物种多样性变化表明其对缙云山亚热带季风气候具有相似的适应性。根据物种多样性大小对 7 个群丛进行排序后发现,立地条件优越、人为干扰较少的群丛, 其物种多样性相对更高。
归一化互熵二维矩阵多样性的计算方法
归一化互熵是一种衡量二维矩阵多样性的有效方式。它利用互熵对关键变量(例如代码中的列变量)的边际熵进行了归一化处理。这种方法不仅适用于生态系统中的生物多样性评估,还可以应用于各类关注变量交互多样性的系统。
云南稻作区域品种多样性地理分布与环境、文化关联性研究
稻作品种多样性地理分布格局及其成因是有效保护稻种资源的前提。本研究利用云南地区稻作品种地理分布数据库、自然环境背景信息和不同民族的人口分布数据,结合地理信息系统平台和统计分析方法,探讨了云南地区稻作品种多样性的地理分布格局及其与环境因素和民族文化之间的关系。研究发现,云南地区稻作品种的多样性中心主要集中在云南南部地区;傣族、哈尼族、拉祜族和布朗族的人口比重与稻作品种的丰富度之间均存在极显著的相关性(P
研究河北省承德市及周边地区粘细菌多样性
本研究采用本实验室独创或改进的粘细菌分离纯化技术,对河北省承德市及周边地区的372份土壤和生态样品中的粘细菌进行了系统分离纯化和初步鉴定。分析结果显示,从这些样品中分离出了来自7个属的300余株粘细菌,包括Archangium、Myxococcus、Cystobacter、Corallococcus、Melittangium、Stigmatella和Nannocystis。地点、样品性质及生态环境对粘细菌种群分布和多样性有显著影响,特别是在营养丰富的区域,粘细菌数量和多样性较高。
roimehrez/DDIS 使用MATLAB开发的具有可变形多样性相似性的模板匹配
此代码实现了Wild算法中的快速模板匹配,通过计算图像中模板位置的似然图来解决问题。使用光栅扫描技术计算图像地图,而DDIS(Deformable Diversity Similarity)则用于评估每个子窗口与模板之间的相似性。详细信息请参阅Talmi等人的文章“具有可变形多样性相似性的模板匹配”(2016)。项目页面链接:http://cgm.technion.ac.il/Computer-Graphics-Multimedia/Software/DDIS/
人造生物眼的必要性
满足视力受损人群的迫切需求 提供先进的视觉体验,超越传统疗法