fMRI

MATLAB代码实现了从静止状态fMRI BOLD信号中估计触发血液动力学响应的伪事件发作。基于点过程理论，使用模型检索事件与HRF发生及形状之间的最佳滞后，采用具有两个导数的规范形状或平滑的有限冲激响应。每个体素的HRF检索后，可在时间序列中对其进行反卷积以改进基于滞后的连接性估计，或映射形状参数作为病理生理指标。输入可以是3D或4D图像，或直接矩阵格式[观察x体素]。支持使用时间掩码排除特定时间点。Python软件包和BIDS-App已开发，可重复和轻松进行分析。

一组Matlab和SPM12脚本，用于优化fMRI数据集的图像和时间序列质量指标计算及可视化。受PCP-QAP和MRIQC启发，此工具为熟悉SPM12和Matlab的fMRI技术人员提供便捷的质量控制功能。尽管其相对性质取决于扫描仪位置、采集时间和数据格式，但可为研究人员提供关于潜在数据质量问题的有用见解。

Matlab代码演示了如何使用MCMC方法将ODC模型拟合到fMRI数据。该方法由Chaimow等人（2018）开发，处理功能性MRI数据，以反映血氧水平对神经活动的空间特异性响应。代码包括模型和MCMC算法的主要部分，可在本地或HPC群集上运行。示例数据来自Chaimow等人的研究，展示了在处理过的fMRI数据上的模型应用。

在神经影像学研究中，交叉验证LOOCV matlab代码的应用是探索混合效应多级分析(MEMA)和典型相关分析(CCA)的分析框架。这些方法适用于血氧水平依赖性(BOLD) fMRI体积数据分析，针对个体水平的数据进行精确评估，例如使用GLM模型和最小二乘限制最大似然估计。此外，行为数据的标准化分析显示了行为与神经活动之间的潜在联系。

matlab图像清晰化实现代码先验如何影响多感知知觉。该代码与实验和论文紧密相关，已上传原始研究结果。更多信息和刺激请参见相关资源。原始版本的fMRI和行为实验运行脚本分别存放在fMRI和psychophysics文件夹中（最初在matlab 2010a和psychtoolbox 3.09中运行）。仍需改进文档。初始刺激存储于OSF私人项目中，因演员视频内容未充分开放。如需了解更多，请联系我们。用于分析的原始脚本存放在fMRI_analysis文件夹中，但文档记录尚不完善，用于后代和档案目的。其他未发布或提及的多项分析脚本存放于存储库archives分支的archive文件夹中。我已为原始fMRI数据制作了BIDS数据集。目前正在审核该功能磁共振成像研究的道德许可，以便全面开放数据。请谅解，如需了解详情，请联系我们。