一组Matlab和SPM12脚本,用于优化fMRI数据集的图像和时间序列质量指标计算及可视化。受PCP-QAP和MRIQC启发,此工具为熟悉SPM12和Matlab的fMRI技术人员提供便捷的质量控制功能。尽管其相对性质取决于扫描仪位置、采集时间和数据格式,但可为研究人员提供关于潜在数据质量问题的有用见解。
Matlab和SPM12脚本改善fMRI数据质量检查工具
相关推荐
用卷积滤波器MATLAB代码-主动听取演示代码与SPM12版本7487兼容
用卷积滤波器MATLAB代码积极倾听的演示代码,与SPM12版本7487兼容。这段代码源自惠康神经成像信任中心的本地SPM版本,目前正在审查中并尚未发布为公共版本。代码附带了有关主动听取的论文概述,并提供一个简单脚本以演示论文中的关键原理。结果取决于使用随机数种子生成的先验条件,这使得数字演示具有一定的随机性和独特性。总体而言,这些代码展示了对主动监听程序的参数变化具有鲁棒性的重要原理。
Matlab
0
2024-08-27
SpikeAnalyzer fMRI时间序列非生理性峰值检测MATLAB工具(SPM函数)
SpikeAnalyzer 是一个MATLAB工具,帮助检测fMRI时间序列中的非生理性峰值(异常值)。虽然它不能替代人工检查,但它能够帮助您挑选出可疑扫描,供进一步分析,如使用SPM工具中的spm_movie进行详细查看。
SpikeAnalyzer提供了两种检测方式:
通过对EPI系列总体活动的一阶导数进行阈值判断;
通过对运动速度进行阈值判断。
所有超过设定阈值的扫描将被标记为可疑扫描(即潜在的异常扫描)。在可视化图中,第一种方式检测到的峰值将以浅蓝色的垂直条形式显示,而第二种方式检测到的峰值则以浅红色标记。
您可以通过这些图形直观地看到峰值在全局活动中的“跳跃”,或者在一阶导数中以突然的变化出现。一阶导数方法尤为适用于定义阈值,因为除了某些轻微波动外,原始全局均值曲线即使在跳跃后通常也能接近零。这些“跳跃”现象可能是由扫描仪故障或对象移动造成的。
为了评估后者原因,SpikeAnalyzer结合对象运动参数来在定义的扫描窗口内预测全局均值(默认值)。
Matlab
0
2024-11-06
导入Excel到MSSQL2005脚本
使用T-SQL脚本将Excel数据导入SQL Server 2005
SQLServer
3
2024-04-30
Hadoop SSH免密登陆脚本优化
在IT领域,特别是在分布式计算中,Hadoop作为广泛采用的开源框架,对大数据的处理和存储起着关键作用。SSH(Secure Shell)作为安全远程登录和命令执行的协议,在管理诸如Hadoop集群等分布式系统时尤为重要。免密登陆是SSH的一项关键功能,通过使用SSH密钥对(公钥和私钥),允许用户在不同节点间实现无需密码的快速切换,从而提升管理效率。配置Hadoop免密登陆涉及生成密钥对、复制公钥到目标服务器、配置SSH别名等步骤,确保集群节点的便捷访问和安全性。
Hadoop
0
2024-08-08
Oracle XTTS V4脚本学习思维脑图的探索
随着技术的不断进步,Oracle XTTS V4脚本学习思维脑图已成为一个重要的研究课题。
Oracle
0
2024-08-31
Centos系统自动化安装Mysql 5.7.29脚本及安装包
为简化在Linux系统上频繁安装Mysql数据库的流程,该资源提供了一个自动化安装脚本和所需的安装包。该资源包含以下内容:
mysql-5.7.29-el7-x86_64.tar.gz:Mysql 5.7.29安装包
Mysql_install.sh:自动化安装脚本
my.cnf:Mysql配置文件
Readme.sh:使用说明
mysqlpwd.sh:初始密码修改脚本
MySQL
2
2024-05-25
BIDS格式下fMRI数据集的CPP分析脚本
典型相关分析matlab实现代码的质量和样式单元测试覆盖如何引用贡献者SPM12预处理管道说明依赖关系确保安装以下工具箱并将其添加到matlab路径。详细说明请参见以下链接:依赖关系的第二版本20或者4。为了简便起见,已将subfun工具箱添加到子文件夹中。此功能套件通常包括从读取和解压缩数据开始的步骤。然后,它依次执行切片定时校正、空间预处理(重新对齐到MNI空间)、平滑主题级别的GLM以及组级别的GLM(即汇总统计方法)。每个任务必须独立运行。所有参数最好在getOptions.m文件中修改。此外,还可以为每个受试者的非规范化图像运行GLM,以准备进行MVPA分析,并为MVPA中每个条件获取一个beta图像。核心功能位于子功能文件夹subfun中。管道的假设包括:虚拟扫描已从BIDS数据集中删除,并且可以直接进行预处理;给定任务的元数据与运行管道的第一个主题的第一次运行的元数据相同;该组在主题字段上是同质的。
Matlab
0
2024-10-01
SPM 版本切换工具:setSPMversion
setSPMversion 是一个 MATLAB 工具,允许用户在不退出 MATLAB 或手动修改路径的情况下切换不同的 SPM 版本。
Matlab
2
2024-05-29
Matlab开发变量名称检查工具
Matlab开发中的变量名称检查工具能够识别潜在的函数或内置函数冲突。该工具帮助开发者确保变量命名的准确性和独特性,从而提高代码质量。
Matlab
0
2024-08-10