该脚本使您可以轻松地从HCP-MMP1.0分解图集中提取特定的体积二进制掩码文件。首先,下载所有文件并解压缩HCP_atlas.zip
。请确保地图集文件(.nii)和mmp.csv
文件位于同一文件夹中。使用方法如下:这是一个简单的脚本,用于获取人类Connectome项目的MMP1.0碎片,提取所需的ROI并保存为二进制掩码文件。体积图位于MNI空间中,因此生成的蒙版文件也将位于该空间。请查阅ROI查找表(mmp.csv
),找到感兴趣的ROI并记录其代码(num.roi列)。您可以运行多个ROI或仅运行一个。调用create_HCP_mask()
函数,输入查找的roi代码,指定地图集文件的文件夹和输出文件夹。操作选项包括:选择保存“单个”ROI或将它们合并为一个大的ROI(“sum”),提取左侧('l')、右侧('r')或双向('b')ROI,选择是否扩大生成的ROI蒙版。该脚本将自动执行后续步骤。
HCP-MMP1.0掩码提取脚本
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