QuBiT(生物管定量工具)是一种用于准确、可重复测量细生物管的3D Matlab脚本集合,特别适用于分段共焦堆栈数据,例如Ilastik的输出。该工具集最低要求硬件包括8GB内存、2.5GHz处理器,操作系统支持MacOSX 10.5(Leopard),软件需安装Matlab 2014b。QuBiT中的各个Matlab脚本按照图像分析方法的流程顺序排列。模块1:导入管并骨架化(s1_import_tubes)负责导入和处理管的分割数据,使用MSFM算法实现骨架化处理。模块2:显像管(s2_display_tubes)用于3D可视化分段和骨架化的管,确保骨架的准确性。