Matthew J.Scarborough版权(c)2020,联系方式:本自述文件描述了两种混合培养发酵代谢模型的使用:单细胞批量模型和混合社区模型先决条件-两种代谢模型都是用python编写的。可以使用CobraPy创建Matlab版本。 -使用COBRA框架进行代谢建模的Python软件包-适用于Python的数据分析库-用于科学计算的Python软件包-数学函数模块推荐软件-用于构建模型的集成开发环境型号说明iFermCell215 iFermCell215是具有156个React的单细胞代谢模型。该模型包含用于发酵途径的途径,包括反向b-氧化,并且能够使用多种底物。它包含三个部分:细胞质(c),细胞外空间(e)和用于产生离子动力的部分(i)。 iFermGuilds789 iFermGuids789是一个社区代谢模型,其中564个React分布在六个功能行会中。六个行会分别包含在iFermCell215中获得的React子集。行会是简单的制糖发酵罐,可产生乙酸盐,乳酸盐和乙醇(SFO),可产生铁氧还蛋白
Matlab编程与混合文化发酵模型集成
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