MATLAB中COBRA工具箱的算法代码存档及安装要求

COBRA工具箱是基于约束的重构和分析工具箱，满足MATLAB系统要求和求解器安装。确保您的系统配置正确，并安装兼容的求解器如TOMLAB，IBM ILOG CPLEX，GUROBI或MOSEK。通过克隆存储库安装COBRA工具箱，使用命令：$ git clone --depth=1 https://github.com/opencobra/cobratoolbox.git cobratoolbox。请查阅initCobraToolbox教程、文档和支持以了解更多信息，并从目录中运行所有教程。如有需要，请访问我们的网站获取支持或发布问题。

该软件包提供了论文“通过结合基因表达和基因突变数据来推断基因网络重新布线”的Matlab代码README文件：涂俊杰，L.Ou-Yang，XH Hu和XF Zhang（2018）。该档案包含几个文件夹：（1）代码：用于解决GNRM模型的源代码。（2）模拟：使用模拟数据测试我们的方法的演示。在文件夹“simulation”中运行“Demo_simulation.m”以测试算法。（3）卵巢癌：使用卵巢癌基因表达数据测试我们方法的演示。在文件夹“Ovarian cancer”中运行“Demo_Ovarian.m”以测试算法。请不要犹豫与屠佳娟联系寻求任何澄清关于档案的任何内容或操作。联系方式：涂家娟，华中师范大学数学与统计学院，武汉430079。

ATRIA是R中一个快速、精确且近似的最近邻工具箱，它包含两组函数，用于计算数据集的分形或固有维数。该软件包包含实现，这是球树算法系列的一种变体，支持精确和近似的k最近邻和范围搜索。对于在高维空间中不均匀分布的点，ATRIA可能是一个不错的选择。Boxcounting方法将数据集的点合并到D维网格中，并根据点在网格框中的分布来计算各种统计信息。计算不同网格分辨率下的非空盒子的数量可以估算数据集的容量维度。

Matlab 遗传算法工具箱及应用源码示例。源码包含工具箱、调试说明和算例。工具箱有助于熟悉和了解遗传算法原理和计算过程。工具箱比较容易使用，有助于培养对遗传算法的兴趣。

随着技术的进步，MATLAB中的遗传算法工具箱（GATBX）正逐步成为工程学习者不可或缺的资源。

Matlab工具箱中包含了hosvd代码的实现及其应用示例。为了运行这些代码，需要下载并安装Tensor Toolbox for MATLAB（版本3.2.1）。下载完成后，解压缩到matGadgets目录，并添加路径'addpath('tensor_toolbox-v3.2.1')'。代码包括demo.m，展示了如何使用fullTucker函数进行数据分解，以及fullTucker.m的详细实现。此外，还包含了用于数据集文件名处理的twoDigits.m，特征矩阵排序的sortem.m，以及从目录中读取文件的readTensorFile.m功能。

Matlab图论算法工具箱 本工具箱提供了多种图论算法的Matlab实现，涵盖了图的创建、遍历、搜索、最短路径、最小生成树等经典算法。代码注释清晰，方便使用者理解和修改。 ### 工具箱功能 图的表示: 支持邻接矩阵和邻接表两种图的存储方式。 图的创建: 提供手动输入和文件读取两种图的创建方式。 图的遍历: 实现深度优先搜索 (DFS) 和广度优先搜索 (BFS) 算法。 图的搜索: 提供Dijkstra算法、Bellman-Ford算法、Floyd-Warshall算法用于计算单源/多源最短路径。 最小生成树: 实现Prim算法和Kruskal算法用于计算图的最小生成树。 ### 使用说明 将工具箱文件添加到Matlab路径。 参考示例代码，根据需求调用相应的函数。 根据实际问题修改参数和函数。 ### 应用领域 本工具箱适用于网络优化、交通规划、路径规划、物流配送等领域，帮助用户快速进行图论算法的仿真和分析。

MATLAB工具箱介绍-GATBX遗传算法工具箱。数学、统计与优化工具包包括：1.符号数学工具箱，2.偏微分方程工具箱，3.统计学工具箱，4.曲线拟合工具箱，5.优化工具箱，6.全局优化工具箱。信号处理与通信工具包包括：1.信号处理工具箱，2.DSP系统工具箱，3.通信系统工具箱，4.小波工具箱，5.定点运算工具箱，6.射频工具箱，7.相控阵系统工具箱。控制系统设计与分析工具包包括：1.控制系统工具箱，2.系统辨识工具箱，3.模糊逻辑工具箱，4.鲁棒控制工具箱，5.模型预测控制工具箱。图像处理与计算机视觉工具包包括：1.图像处理工具箱，2.计算机视觉工具箱，3.图像采集工具箱，4.OPC工具箱。

MATLAB中存档算法代码，通过通用FTP协议实现数据传输与存储。