Premessa是一个专为流式细胞和大规模细胞计数数据设计的R软件包,支持FCS文件的面板编辑和重新命名,以及基于微珠的归一化和去条形码。该工具由Parker癌症免疫疗法研究所开发并版权所有(2016年)。在使用此软件前,请务必备份数据。安装要求包括CRAN提供的devtools软件包和Bioconductor的flowCore软件包。安装过程简单,只需打开R会话,依次执行所需的命令即可。
使用Matlab的彩色编码强度处理工具Premessa-R包,优化质量和流式细胞仪数据预处理
相关推荐
PolarFCS: 用于流式细胞术数据多参数可视化的 MATLAB 工具
PolarFCS 是一款基于 MATLAB 平台开发的流式细胞术数据可视化工具,能够对多参数数据进行分析和展示。该工具首先计算每个细胞事件的多个参数质心,然后在二维散点图上绘制出来。散点图的坐标轴对应于不同的输入参数,用户可以根据需求对坐标轴进行调整和缩放。
软件获取与安装
PolarFCS 以 MATLAB 语言编写,为了方便用户使用,开发者提供了 Windows 和 MacOS 平台的预编译二进制文件。用户需要下载并安装相应的 MATLAB 运行时环境 (R2016b 版本)。
对于熟悉 MATLAB 编程的用户,可以下载源代码并根据自己的需求进行修改。源代码位于 makefcspolarscatter.m 文件中。
非 MATLAB 用户需要安装 MATLAB 运行时环境。请确保选择与 PolarFCS 兼容的操作系统和版本 (R2016b)。
获取 PolarFCS
访问 PolarFCS 的 GitHub 页面,点击“克隆或下载”,然后选择“下载 Zip”即可下载软件包。
Matlab
3
2024-05-30
数据预处理工具 Weka 教程
数据准备
无用属性去除:- 去除无用信息,如 ID。
离散化:- 处理数值型属性,使其符合算法要求(如关联分析)。
例如:“children”属性,修改为 {0,1,2,3}。
数据挖掘
6
2024-04-30
数据预处理工具Python脚本的实现
-- 编码:utf-8 -- 从pandas导入pd 从sklearn导入预处理 导入pickle 导入时间 导入时间的当前时间 计算时间() '''打印当前时间格式:return:返回当前时间的字符串''' 返回时间.strftime('%Y-%m-%d %X',时间.localtime()) class DataPre: '''数据预处理器初始化需要清洗好的数据。它提供了唯一的外部接口:load_data()。它返回处理好的数据。如果数据存在,则返回它。否则将执行一系列预处理操作并返回处理好的数据。 ''' 首先打开(self,train_data,test_data) self.train_datas=pd.read_csv(train_data,index_col=['SK_ID_CURR']) self.trainlables=self.train_datas['TARGET'] #删除唯一值.self.train_datas.drop(['TARGET'],轴=1,在地方=真实) self.test_datas=pd.read_csv(test_data,index_col=['SK_ID_CURR']) self.test_datas.drop(['Unnamed: 0'],轴=1,在地方=真实) self.train_datas.drop(['Unnamed: 0'],轴=1,在地方=真实) self.test_datas.drop(['previousSCOFR'],轴=1,在地方=真实) #这两个功能全是NAN self.train_datas.drop(['previousSCOFR'],轴=1,在地方=真实) self.test_datas.drop(['previousHomewares'],轴=1,在地方=真实) self.train_datas.dropna(轴=0,如何='全部',在地方=真实) self.train_dat
算法与数据结构
1
2024-07-18
数据预处理技术优化
数据挖掘概念与技术数据预处理是一门极具实用性的课程讲义。
数据挖掘
0
2024-09-13
Matlab图像处理工具-眼动仪开发基于Raspberry Pi
Matlab图像处理工具用于开发基于Raspberry Pi的眼动仪,测量眼位和眼动。这款眼动仪采用眼镜式设计,类似普通眼镜,是大学生创新实验项目的一部分,得到湖南师范大学的资助。
Matlab
0
2024-08-17
预处理和后处理函数-kinco hmiware使用手册
表5.7中列出了kinco hmiware使用手册中的预处理和后处理函数,例如trainb、trainbfg、trainbr等,这些函数主要用于权值和阈值学习规则的批处理训练,以及Bayesian规范化和循环顺序递增更新等功能。
Matlab
0
2024-08-26
优化matlab数据读取及预处理流程
在处理matlab数据时,提升读取和预处理效率至关重要。以下是针对数据读取及预处理的优化方案,包括源程序。
Matlab
0
2024-08-05
PLS和光谱预处理的Matlab程序集合
这里收集了多个关于偏最小二乘(PLS)和光谱预处理的Matlab程序,适合需要的人查阅。
Matlab
0
2024-08-04
数据预处理中的数据集成和变换
数据集成和变换是数据预处理中的关键步骤。集成方法包括合并、链接和增强。变换方法包括归一化、标准化和离散化。这些技术可提高数据质量和可解释性,促进知识发现过程。
数据挖掘
2
2024-05-16