细胞分割

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Matlab中的细胞分割与分析代码
这个存储库包含用于3D单细胞分割和分析的Matlab代码,附有详细的步骤说明。分割分段器是一个用于Matlab的应用,通过阈值化细胞质标记物或膜标记物的分水岭转换,在3D空间中精确分割细胞。用户界面简单易用,允许调整参数以达到最佳分割效果。分析脚本可应用于图像文件夹,并将结果保存为Excel文件,包括通道的阈值识别点和区域的富集和部分重叠分析。
【细胞分割】基于分水岭算法的细胞分离计数matlab程序及GUI.zip
【细胞分割】基于分水岭算法的细胞分离计数matlab程序及GUI.zip
基于自动核分割和CNN模型的白细胞分类
项目概述 本项目提出一种通用的白细胞 (WBC) 核分割算法,并通过四个公开数据集验证其有效性。项目首先通过统计细胞核与白细胞比例确定白细胞的位置,然后设计了一种新的卷积神经网络 (CNN) 模型,对四类定位和裁剪后的白细胞图像进行分类。 代码资源 WBC 核分割、定位和裁剪方法代码: wbc_nucleus_seg_localz 目录 裁剪后的 WBC 图像数据集生成、CNN 模型训练和训练后模型推断代码: wbc_classify_cnn_model 目录 环境要求 推荐使用 MATLAB 2017a、2019a 或更高版本运行代码。
基于阙值、边缘、形态学和种子点的细胞图像分割方法
提出了一种基于阙值、边缘、形态学和种子点的细胞图像分割方法。该方法将图像二值化,提取边缘,并应用形态学操作来填充孔洞并去除噪声。然后,通过种子点选择和区域生长来分割细胞。该方法实现了鲁棒和准确的细胞分割,可用于各种细胞图像。
Matlab细胞轨迹跟踪代码
此存储库包含用于Matlab的灰度处理和细胞跟踪的源代码。该程序支持荧光或暗场电影的处理,以及相衬电影的跟踪。兼容Matlab 2018a及更早版本,支持'.tif'堆栈和'.nd2'文件格式。还提供适用于Linux的版本。
LC3B ROI量化:细菌感染细胞图像分析和细胞内信号提取
此函数以16位TIFF堆栈形式接收图像,并通过解交错处理其三个通道。它对核标记和病原体通道进行阈值处理和分水岭分割,以识别细胞核和细菌。然后,该函数使用病原体质心创建目标区域(ROI),并通过子图像提取病原体周围的细胞内信号。
深蓝-搜狗细胞词转换器
深蓝是搜狗细胞词转换工具,可从搜狗细胞词网站获取领域和类别词。转换格式后,可使用深蓝将文件转换为 Excel 等其他格式,方便处理和使用。
使用Phagosight追踪巨噬细胞MATLAB开发
用于重叠巨噬细胞分析的MATLAB软件包。
分割聚类
聚类分析中的分割聚类技术 数据挖掘算法中的一种聚类方法
【细胞分裂】利用形态学算法编写的红细胞计数matlab源码(包含GUI界面)
【细胞分裂】利用形态学算法开发的matlab源码,可用于红细胞计数,并提供了直观的GUI界面。