PSF

ORIX是一个开放源代码的Python库，专用于分析方向和晶体对称性。该软件包定义了用于分析取向的对象和函数，这些取向表示为四元数或3D旋转矢量，详细说明了晶体的对称性。其功能主要建立在软件包的基础上，并受其启发。如果将ORIX的分析结果用于已发表的论文，请务必引用相关的预印本。此外，您可以在存储库中找到演示。ORIX的发布遵循GPL v3许可。

PSF的Matlab代码光场反卷积 标题：“用于光场显微镜的相空间反卷积”的Matlab代码 本书作者：陆志、吴佳敏、乔慧、游洲等版本：1.0版权：2019，陆志，吴佳敏，乔慧，游洲，陶岩，周紫荆，张旭，范静涛，戴琼海 根据参考文献[1]编辑。 Matlab代码，“用于光场显微镜的相空间反卷积” 该软件包包含了中描述的相空间反卷积算法的实现：陆志，吴佳敏，乔慧和游洲等，“用于光场显微镜的相空间反卷积”。 如果使用该代码在学术出版物中生成数据（例如，图像、处理时间等），请引用我们的论文。 有关算法的详细信息，请参阅我们的论文。 如何使用：1. 在具有Microsoft Xeon和32GB RAM的MS Windows 10 64位版本下的MATLAB 2018b（64bit）中进行了测试。2. 打开包装，将路径中的代码子目录添加到Matlab路径中，运行“main.m”以尝试包含在此软件包中的示例。3. 下载所需的数据。a）中参考图3的光场数据（B16cell的成像）保存在“Raw”中，可用于测试。b）点扩展功能的MAT文件位于目录“PSF”中。 读者还可根据需求进行修改。

psf的matlab代码dviplusimage项目包含HDR图像渲染算法的Matlab代码。该项目为SIM2显示器的DVI PLUS模式开发HDR图像渲染功能，用户可以通过自定义渲染来呈现HDR图像。此软件可用于主观实验和心理测量研究，准确复制HDR图像以匹配显示器参数。您可以简单克隆或下载项目，并在Matlab中运行dviplusimage。每个m文件中均有详细说明：dviplusim.m是Matlab的单文件函数，用于HDR图像渲染，仅需led_psf.mat和lcdGammaCorr.mat文件；dviplusvid.m是Matlab的单文件函数，用于HDR视频渲染；dviplusimage文件夹包含多个文件版本的相同代码，dviplusimage\dviplusimage.m适用于自然图像，dviplusimage\dviplusimageTest.m用于测试不连续图像（如亮度遮罩和对比度研究）。

扩展了 SMALL-LABS，一个用于单分子精确定位的软件，增加了基于 pSMLM 的本地化。代码中包含对 pSMLM 异源 PSF 的描述。

PSF的Matlab代码QC-STORM是一个在线处理插件，专为大FOV超分辨率定位成像设计（适用于Micro-Manager和ImageJ）。在单分子拟合模式下，QC-STORM能够以2048 x 2048像素的100 fps最快帧速率处理sCMOS相机生成的成像数据。即使在高密度激活和多发射极拟合模式下，QC-STORM也能以100 fps处理1024 x 1024像素的图像。用于ImageJ的QC-STORM用于后处理，而Micro-Manager的QC-STORM可以直接从相机获取图像并进行在线处理。QC-STORM已在论文“分而治之：用于超分辨率定位显微镜的多个发射器的实时最大似然拟合”中发表。主要特征包括超高效的MLE定位，以完整的FOV和最快的帧速率在线处理基于sCMOS相机的定位显微镜数据。大多数QC-STORM处理部分都是GPU加速的，性能几乎与GPU的单精度浮点运算速度线性相关。