SPSS提供了三种基本的运行方式：完全窗口菜单方式、程序运行方式和混合运行方式。程序运行方式和混合运行方式允许用户根据特定的分析需求编写自定义的SPSS命令程序进行运行。SPSS的对话框分为文件操作对话框和统计分析对话框，操作界面与常见的Windows应用软件类似。用户可以通过这些对话框选择变量和统计方法进行分析。