这篇指南演示RNA-seq分析的基本流程及其背后的差异基因表达检测。在开始操作之前,建议您先了解一些生物信息学和癌症基因组学的背景知识。将解释基因表达的概念,包括相对值和绝对值的区别,以及单核苷酸多态性和体细胞突变的解释。此外,您还将了解高通量测序(例如illumina)的原理,以及fastq文件和gtf文件的格式。最后,介绍如何使用TCGA数据库及在线工具进行分析,涵盖了cBIportal和GEPIA2的应用。
RNA-seq分析流程基础指南
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