Pajek网络分析工具详解

为了便于学习，这里提供了详细的UCINET网络分析软件操作步骤。UCINET软件由加州大学欧文分校的网络分析团队开发，包括斯蒂芬·博加提、马丁·埃弗里特和林顿·弗里曼。它集成了NetDraw、Mage和Pajek等多种工具，支持多种文件格式的数据读取，如文件、KrackPlot、Pajek、Negopy和VNA等。UCINET能够处理高达32,767个节点的网络数据，尽管在5000至10000个节点时可能会稍有延迟。该软件提供了强大的社会网络分析功能，包括中心性分析、子群分析和基于置换的统计分析。

GRETNA是一个用于基于fMRI、sMRI或dMRI数据进行图论网络分析的工具包。它提供了跨平台的开源软件包，具有图形用户界面(GUI)，支持全局和局部网络特性的拓扑分析。用户可以灵活定义网络节点、处理网络连通性，并选择适当的阈值程序。GRETNA还允许进行统计比较，并评估网络指标与临床或行为变量之间的关系。

在图7.41中，展示了MATLAB工具箱中设施网络分析工具条的27种应用。

在数据分析和挖掘领域，社交网络分析（SNA）已经成为理解复杂关系网络的重要工具。R语言以其强大的统计分析能力和丰富的图形库，成为处理这类问题的理想选择。本主题将深入探讨如何使用R语言构建和分析社交网络图，揭示其中隐藏的关系模式。社交网络图由节点（如个人、组织或事件）和连接这些节点的边（代表他们之间的互动或关系）组成。在R中，我们可以使用包括igraph在内的工具来创建、操作和可视化这些网络图。这些工具提供了丰富的功能，如创建网络、计算度量指标（如度、接近中心性、介数中心性和聚类系数）以及生成可视化图形。通过分析社交网络图，可以洞察网络中的关键人物、信息传播路径和社区结构。

学习有关图算法和社会网络分析的相关知识，可以从国外网站下载。

本存储库包含吕志恒等人使用的基础Matlab代码和函数，用于处理疫情数据并进行社交网络分析。用户需运行“MainCode.m”生成图3、8和扩展数据的基础数据，并运行“DataMaker.m”生成.csv文件。图7的基础数据可通过运行“figure7Code.m”生成。此外，还可使用R代码“plots.r”生成图1、3、6、8及扩展数据的详细图。对于图2、4、5和6，用户应使用从“MainCode.m”和“figure7Code.m”生成的.csv文件重新生成数据。

本程序将复杂网络邻接矩阵转换为 Pajek 网络文件格式，方便进一步分析和可视化。

本研究选取参考咨询领域内32位高度引用的作者作为研究对象，采用社会网络分析方法结合UCINET软件分析这些作者之间的引文关系。通过网络密度分析个体之间引用的频率，通过点度中心度分析核心研究者，中间中心度分析知识传播中的关键人物，以及凝聚子群分析来揭示关系紧密的研究小团体。

以Python语言为工具，本书深入浅出地揭示了动物社会网络的复杂结构和动态变化。通过对真实案例的分析，读者将领略到如何运用Python强大的数据处理能力，构建动物社会网络模型，并从中挖掘出隐藏的社会关系和行为模式。